Estudo de funil de enovelamento de proteinas em rede utilizando analise de componentes principais.

• Processo: 05/55116-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2005
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2007
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Vitor Barbanti Pereira Leite
• Beneficiário: Mariane Lopes de Paiva
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Dobramento de proteína Método de Monte Carlo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Enovelamento De Proteinas | Funil De Enovelamento | Modelos De Rede | Simulacao De Monte Carlo

Resumo

O enovelamento de proteínas é um problema fundamental em biofísica molecular. A teoria aceita, conhecida como energy landscapes, utiliza o funil de energia potencial como conceito fundamental no entendimento do enovelamento de proteínas. O funil ocorre em uma superfície multidimensional de difícil visualização e a investigação de métodos que permitam uma análise quantitativa da estrutura dos funis é importante para a completa compreensão do problema. Um método de visualização quantitativa destes funis foi proposto por Becker (J. Mol. Struct. 398: 507-516, 1997). Neste trabalho empregaremos esta metodologia para estudar a estrutura de funis de proteínas em modelos de rede. Neste método, a dimensionalidade do sistema é reduzida através da análise de componentes principais, permitindo assim a classificação dos mínimos de acordo com a profundidade dos mínimos, altura das barreiras de energia entre os mínimos e conectividade entre eles. Esta informação será obtida através de simulações de enovelamento que utilizam o método de Monte Cario. (AU)