Avaliação do oxidante envolvido na atividade peroxidásica da enzima Cu,Zn-SOD por meio de simulações computacionais

• Processo: 07/58619-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2008
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2010
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
• Pesquisador responsável: Giselle Cerchiaro
• Beneficiário: Tânia Maria Manieri
• Instituição Sede: Centro de Ciências Naturais e Humanas (CCNH). Universidade Federal do ABC (UFABC). Ministério da Educação (Brasil). Santo André , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 07/50765-2 - Estudo de processos oxidativos e radicalares envolvendo o cobre no meio biológico: uma investigação de mecanismos moleculares da atividade oxidante de complexos e proteínas contendo cobre, AP.JP
• Assunto(s): Metaloenzimas Superóxido dismutase Simulação por computador Simulação de dinâmica molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bio-Simulacoes | Cluster De Cobre | Dinamica Molecular | Metaloenzima | Simulacao Computacional | Superoxido Dismutase

Resumo

O papel anti-oxidante da enzima Cu,Zn-Superoxido Dismutase (Cu,Zn-SOD) pode ser perturbado por mutações que levam a uma anormal atividade peroxidásica desta enzima. Tais mutações são frequentemente relacionadas a doenças neurodegenerativas tais como a esclerose lateral amiotrófica (ALS, sigla em inglês). Neste projeto, pretendemos estudar in-silico os detalhes do mecanismo de formação de radicais livres e espécies reativas envolvidos na atividade peroxidásica da Cu,Zn-SOD. Em particular, pretendemos estudar através de métodos de simulação computacional o oxidante envolvido na atividade anormal da enzima Cu,Zn-SOD. Os objetivos deste estudo são o de (a) caracterizar, através de métodos de dinâmica molecular, a dinâmica do sitio ativo da enzima Cu,Zn-SOD a partir de estruturas cristalográficas existentes e (b) determinar os intermediários reativos na reação de dismutação na presença e ausência do tampão bicarbonato/dióxido de carbono. A determinação dos intermediários reativos pode levar a uma maior compreensão do mecanismo presente em doenças neurodegenerativas como a ALS, alvo de intensos estudos de grupos de pesquisa no Brasil e no exterior. (AU)