Algoritmo evolutivo baseado em modelo lattice e em modelagem combinatorial para modelagem de estruturas de proteínas

• Processo: 04/10991-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2005
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2007
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação
• Pesquisador responsável: Alexandre Cláudio Botazzo Delbem
• Beneficiário: Paulo Henrique Ribeiro Gabriel
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Assunto(s): Computação bioinspirada Biologia computacional Redes neurais (computação) Algoritmos genéticos Proteínas Elementos estruturais de proteínas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Algoritimos Evolutivos | Bioinformatica De Proteinas | Computacao Bioinspirada | Modelagem De Proteinas | Redes Neurais

Resumo

Proteínas são polímeros constituídos por um conjunto de aminoácidos organizados na forma de cadeias, os quais determinam a estrutura espacial das proteínas e, conseqüentemente, sua função. Entender a função de uma proteína implica, portanto, em determinar a sua estrutura espacial. A obtenção da estrutura em laboratório requer processos demorados e caros. Buscando uma alternativa para determinação de estruturas de proteínas de forma mais eficiente e menos custosa, ferramentas computacionais têm sido desenvolvidas para o cálculo de estruturas espaciais a partir das cadeias de aminoácidos. No entanto, as ferramentas existentes não têm apresentado eficiência computacional apropriada. Este projeto de pesquisa busca o estudo, a descrição e a análise de algumas ferramentas computacionais disponíveis para a determinação de estruturas de proteínas. Além disso, será implementada uma ferramenta para modelagem de estrutura secundária de proteína, baseada em redes neurais artificiais, e uma para estrutura terciária, baseada em algoritmos genéticos. (AU)