Inferência de Redes Regulatórias de Genes de Baculovirus

• Processo: 09/02730-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2009
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Paolo Marinho de Andrade Zanotto
• Beneficiário: Hagit Katzov
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Filogenia Baculoviridae Redes reguladoras de genes Biologia sistêmica Expressão gênica Virologia molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: baculovirus | biologia sistêmica | expressão gênica | Filogenética | Redes regulatórias gênicas | Virologia Molecular | Biologia Molecular de Baculovirus

Resumo

Os Baculovirus, além de serem amplamente utilizados como vetores em biologia molecular, são importantes agentes no biocontrole de pragas. Embora existam vários estudos no nível genômico, nosso entendimento em relação a regulação gênica, interação e função dos genes é limitado. O presente projeto tem como objetivo a modelagem da rede regulatória gênica (GRN - gene regulatory network) dos virus da família Baculoviridae. Este trabalho será realizado através de técnicas de bioinformática, a partir das quais pretende-se desenvolver e aplicar modelos para estudar os mecanismos de regulação dos genes da família Baculoviridae. Com isso, pretende-se reconstruir as redes de regulação de genes a partir de dados gerados em ensaios experimentais (PCR em tempo real e dados de microarray) relacionados ao transcriptoma dos baculovirus.Os resultados desse projeto fornecerão informações necessárias para a predição de funções gênicas, além de contribuir para o entendimento dos fatores necessários a regulação gênica. A questão chave que pretendemos responder com este trabalho é: Quais são os motivos necessários e as redes regulatórias em baculovirus que predizem uma função gênica? As hipóteses são: 1. A rede regulatória gênica em baculovirus são modulares, robustas e consistem em elementos recorrentes. 1.2. A rede regulatória dos baculovirus é composta por pequenos conjuntos de elementos regulatórios, o que forneceria a base para regulação gênica como um todo. 1.3. As funções gências em baculovirus podem ser preditas por comparação de dados filogenéticos com dados de expressão e regulação gênica. A rede regulatória gênica modelada neste estudo fornecerá ferramentas para a descrição e análise da complexa rede regulatória da família Baculoviridae.