Identificacao de rearranjos associados as extremidades dos cromossomos de leihmania major.

• Processo: 05/54130-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2005
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2007
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
• Pesquisador responsável: Angela Kaysel Cruz
• Beneficiário: Patrícia de Cássia Ruy
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Leishamnia Major | Rearranjos Genomicos

Resumo

O grande volume de dados genômicos disponíveis torna a análise manual da informação impraticável, dessa forma se torna premente o emprego de computadores e abordagens de bioinformática para interpretação desses dados e extração da significância biológica, colocando essas informações no contexto do nosso entendimento biológico. A Leishmania é um protozoário parasita de importância médica que afeta milhões de pessoas anualmente segundo dados da OMS (Org. Mundial de Saúde). Nesse projeto utilizaremos a seqüência genômica de L. major para estudo dos rearranjos genômicos identificados no parasita. O estudo de rearranjos genômicos pode contribuir para o entendimento da diversidade genética entre os genomas de tripanossomatideos, para a elucidação dos aspectos evolutivos e dos mecanismos que orquestram as mudanças de ordem gênica e sua distribuição entre cromossomos, além disso, podem revelar "pontos quentes" de mutação que em última instância podem estar ligados à virulência do parasita. Para esse estudo, dentro desse projeto utilizaremos técnicas de bioinformática que incluem: a) análises de similaridade de seqüência; b) a utilização/adaptação dos algoritmos existentes para caracterização das recombinações; c) o desenvolvimento de "scripts" PERL e BASH para acesso e extração dos resultados das análises; e e) desenvolvimento de ferramentas de visualização gráfica para caracterização, criação de banco de dados MySQL e mapeamento dos eventos recombinatórios identificados. (AU)