Avaliacao funcional de transcritos de "leishmania" com caracteristicas nao usuais.

• Processo: 00/15061-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Angela Kaysel Cruz
• Beneficiário: Simone Aparecida Antoniazi
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 99/12403-3 - Do genoma à biologia de Leishmania: uma abordagem compreensiva, AP.TEM
• Assunto(s): Genomas Interferência de RNA Leishmania
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Genoma | Interferencia De Rna | Leishmania | Rnai

Resumo

Seqüências expressas com características não usuais de Leishmania foram parcialmente caracterizadas no subprojeto "Estudo funcional de seqüência expressa de função desconhecida", incluído em Projeto Temático do laboratório. Uma análise comparativa entre ESTs de Lmajor Friedlin ("identificados" e "não identificados') revelou um grupo de seqüências (37% da população de não " identificados") que não apresentam homologia ou similaridade significativa em bancos de dados disponíveis, e têm como características não usuais, para o organismo, alto conteúdo de AT e tamanho menor que 0.7 kb. A distância entre o códon de iniciação e de terminação é tal que não caracteriza o tamanho mínimo de uma ORF (225 nucleotídeos), e 56% dos transcritos menores que 0.7kb não contêm uma ORF. Como vários RNAs não codificadores (ncRNA) de diferentes funções vêm sendo identificados, em diversos organismos, é importante também a busca destas seqüências em Leishmania. Partindo da análise comparativa destes ESTs "desconhecidos" parcialmente caracterizados, pretendemos fazer uma avaliação funcional dos transcritos, iniciando com a definição de sua conservação em diferentes espécies e distribuição no genoma. E assim identificar e estudar estas moléculas de RNA para compreender seu papel funcional. (AU)