Mapeamento de sequências repetitivas em Medicago truncatula: construção de um modelo cromossômico e fechamentos de gaps centroméricos

• Processo: 10/07207-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Novas Fronteiras
• Data de Início da vigência: 15 de setembro de 2010
• Data de Término da vigência: 14 de setembro de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia
• Pesquisador responsável: Mateus Mondin
• Beneficiário: Mateus Mondin
• Pesquisador Anfitrião: John Seymour Heslop-Harrison
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Leicester, Inglaterra
• Assunto(s): Melhoramento genético vegetal Genômica comparativa Citogenética vegetal Sequências repetitivas de ácido nucleico Heterocromatina Medicago truncatula
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Citogenética Vegetal | epigenética | genômica comparativa | Heterocromatina | Organização do Genoma | Seqüências repetitivas | Melhoramento Vegetal

Resumo

Os programas de sequenciamento, atualmente, evitam ou não contemplam regiões de DNAs repetitivos, principalmente aqueles organizados in tandem, por não permitirem um caminhamento cromossômico preciso. Entretanto, a técnica de hibridação molecular in situ fluorescente (FISH) tem se mostrado uma poderosa ferramenta para o fechamento de gaps de regiões de DNA repetitivo, uma vez que o tamanho e a intensidade dos sinais das sondas refletem diretamente o tamanho do arranjo em uma determinada região cromossômica. Assim, a citogenética tem sido colocada nos últimos anos em posição de destaque dentro dos programas de sequenciamento de genomas completos. A espécie Medicago truncatula, com 2n=2x=16 (1C=466 Mpb), é a planta modelo para estudos genéticos dentro da família Leguminosae, por ter um genoma relativamente pequeno, por ser cultivada como forrageira, ser filogenéticamente próxima a espécie cultivada M. sativa e por sua proximidade com outras espécies de importância agronômica. O sequenciamento completo do genoma desta espécie modelo encontra-se em fase final, entretanto, pouco foi explorado com relação às sequências de DNAs repetitivos e os gaps dos arranjos in tandem pericentroméricos não serão concluídos. O Consórcio de Sequenciamento do Genoma de Medicago truncatula, considera a citogenética como etapa e ferramenta crucial para o fechamento dos gaps e para o entendimento da organização do genoma.Este projeto tem como principal objetivo explorar as sequências repetitivas encontradas no genoma de Medicago truncatula, principalmente através do mapeamento via FISH nos cromossomos, contribuindo para o desenvolvimento de um modelo cromossômico e para o fechamento dos gaps das regiões heterocromáticas pericentroméricas. (AU)