Bioprospecção de metabólitos antimicrobianos em metagenoma do bioma Mata Atlântica

• Processo: 02/10997-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2003
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2005
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia
• Pesquisador responsável: Gilson Paulo Manfio
• Beneficiário: Fabiana Andrielli
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Antibióticos Biotecnologia Enzimas Metagenoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Antibioticos | Biblioteca De Dna | Bioprospeccao | Biotecnologia | Enzimas | Metagenoma

Resumo

A diversidade microbiana do solo é bastante estudada por ser fonte de diversos compostos bioativos e enzimas utilizados atualmente (antibióticos, drogas anticâncer, agentes imunossupressores, herbicidas, antiparasitários e inseticidas, entre outros). Contudo, técnicas tradicionais de isolamento e cultivo não abrangem a recuperação real da comunidade microbiana de solos, pois muitos microrganismos não crescem nas condições de cultivo comumente utilizadas em laboratório. Assim, o emprego de metodologias tradicionais de isolamento e cultivo pouco tem contribuído na descoberta de novos compostos na indústria de biotecnologia O conjunto de genomas da microbiota total de uma comunidade é chamado metagenoma e contêm mais informação genética que a verificada na diversidade microbiana cultivada. Pesquisas recentes apontam a construção e triagem/seleção de bibliotecas de DNA da comunidade microbiana do solo como uma alternativa para exploração do metagenoma em amostras ambientais. O projeto visa a realização de ensaios de triagem de alta eficiência para detecção atividades específicas em uma biblioteca metagenômica de solo de Mata Atlântica. A biblioteca será construída utilizando o vetor pBeloBAC no hospedeiro Escherichia coli. Os clones serão ensaiados para avaliação da atividade antimicrobiana contra Gram-negativos, Gram-positivos, leveduras e fungos filamentosos. A concentração mínima inibitória dos antimicrobianos e a prospecção de atividade enzimática dos clones (através de ensaios de degradação em meio sólido) também serão determinadas. (AU)