Variabilidade genetica em locos homologos a genes de resistencia de cana-de-acucar.

• Processo: 00/06496-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2000
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Luis Eduardo Aranha Camargo
• Beneficiário: Mariana Senna Quirino
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Resistência à doença Análise de sequência de DNA Etiquetas de sequências expressas Marcador molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Est | Marcador Molecular | Resistencia A Doenca | Saccharum Officinarum | Sequenciamento Genomico | Xanthomonas Albilineans

Resumo

O projeto objetiva amplificar fragmentos genômicos utilizando primers sintetizados com base em seqüências de ESTs homólogos a genes de resistência. Serão selecionados ESTs que apresentam alta homologia a genes de resistência já clonados. Os fragmentos genômicos serão amplificados e clonados de uma variedade resistente e de uma suscetível a Xanthomonas albilineans. Vários clones serão seqüenciados com o intuito de identificar alelos diferentes por meio de polimorfismos de seqüência nucleotídica. Levando-se em conta a natureza octo-decaplóide da cana-de-açúcar, ate dez alelos diferentes poderão ser encontrados por loco. Com base na seqüência destes e freqüência de polimorfismos, primers específicos para cada alelo poderão ser então sintetizados. Estes primers alelo-específicos serão utilizados para amplificar fragmentos de uma coleção de aproximadamente 30 variedades suscetíveis e 30 resistentes a bactéria com o intuito de verificar se determinado alelo esta presente em uma coleção e não em outra, o que poderia ser uma indicativa da ligação entre este alelo e um gene de resistência ao patógeno ou mesmo ser este alelo o responsável pelo fenótipo resistência. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

QUIRINO, Mariana Senna. Polimorfismos de seqüência nucleotídica em fragmentos genômicos de cana-de-açúcar homólogos a genes de resistência.. 2003. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.