Implicações funcionais de eventos de splicing alternativo no proteoma humano

• Processo: 02/02297-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2003
• Data de Término da vigência: 10 de abril de 2006
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Paulo Sergio Lopes de Oliveira
• Beneficiário: Fabio Passetti
• Instituição Sede: Instituto do Coração Professor Euryclides de Jesus Zerbini (INCOR). Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP (HCFMUSP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Processamento alternativo Proteoma Transcriptoma Genoma humano
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Exon | Genoma | Intron | Proteoma | Splicing | Transcriptoma

Resumo

A pós-genômica surgiu como um próspero campo para que os milhares de seqüências provenientes dos projetos genoma tenham o seu significado biológico elucidado. Um dos mecanismos descritos na literatura como capaz de gerar surpreendente diversidade protéica é splicing alternativo. Entretanto, como aproximadamente 5% das proteínas humanas tenham a sua estrutura cristalográfica resolvida, pouco se sabe dos efeitos de eventos de splicing alternativo na função das proteínas. Por meio do alinhamento entre as seqüências dessas proteínas com estrutura terciária conhecida e o genoma humano, isoformas que não possuíam estrutura protéica conhecida, podem ser alvos de modelagem. O presente projeto tem como objetivos: 1) montagem de uma base de dados relacional contendo a informação do mapeamento das proteínas com estrutura cristalográfica resolvida no genoma humano; 2) definição dos genes que contenham tanto estas proteínas como eventos de splicing alternativo em seus transcritos; e 3) modelagem molecular por homologia daquelas isoformas candidatas de genes com splicing alternativo. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

PASSETTI, Fabio. Implicações funcionais de eventos de splicing alternativo no proteoma humano. 2007. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME/SBI) São Paulo.