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Estabelecimento de um banco de dados de expressed-sequence-tag (est) de Trichoderma reesei: uma abordagem para explorar o controle metabólico da expressão gênica

Processo: 99/10780-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de dezembro de 1999
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2002
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Hamza Fahmi Ali El-Dorry
Beneficiário:Felipe Santiago Chambergo Alcalde
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):DNA complementar   Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos   Etiquetas de sequências expressas   Expressão gênica   Trichoderma reesei

Resumo

Trichoderma reesei é um fungo filamentoso, considerado um dos mais eficientes produtores de um sistema multienzimático induzível de enzimas celulolíticas que catalisam a hidrólise da celulose a glicose. O sistema celulolítico de T. reesei é induzido por celulose e soforose, em pelo menos 1000 vezes e reprimido por glicose. Sendo empregado como organismo modelo para o estudo da expressão gênica regulada por carboidratos em eucariotos. Encontra-se em andamento o seqüenciamento EST de uma biblioteca de cDNA de T. reesei, o que permite fazer a análise de similaridade contra a base pública de dados para a identificação positiva de genes conhecidos ou determinação de novos genes. O estabelecimento de um banco de dados EST deT. reesei (dbEST) permite conhecer o genoma estrutural do fungo a partir do qual podemos fazer o estudo do genoma funcional. A hibridização diferencial de genes representados por os ESTs de cDNA, com sondas obtidas a partir de micélio vegetativo de T. reesei, cultivado em meio com distinta fonte de carbono (celulose, glicose ou soforose); nos permitirá avaliar a expressão gênica em resposta da variação metabólica e identificar os genes expressos ou reprimidos nessas condições, usando a tecnologia de microarray. (AU)