Estabelecimento de um banco de dados de expressed-sequence-tag (EST) de Trichoderma reesei: uma abordagem para explorar o controle metabólico da expressão gênica

• Processo: 99/10780-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 1999
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Hamza Fahmi Ali El-Dorry
• Beneficiário: Felipe Santiago Chambergo Alcalde
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): DNA complementar Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos Etiquetas de sequências expressas Expressão gênica Trichoderma reesei
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cdna | Est | Expressao Genica | Microarray | Trichoderma Reesei

Resumo

Trichoderma reesei é um fungo filamentoso, considerado um dos mais eficientes produtores de um sistema multienzimático induzível de enzimas celulolíticas que catalisam a hidrólise da celulose a glicose. O sistema celulolítico de T. reesei é induzido por celulose e soforose, em pelo menos 1.000 vezes e reprimido por glicose. Sendo empregado como organismo modelo para o estudo da expressão gênica regulada por carboidratos em eucariotos. Encontra-se em andamento o seqüenciamento EST de uma biblioteca de cDNA de T. reesei, o que permite fazer a análise de similaridade contra a base pública de dados para a identificação positiva de genes conhecidos ou determinação de novos genes. O estabelecimento de um banco de dados EST de T. reesei (dbEST) permite conhecer o genoma estrutural do fungo a partir do qual podemos fazer o estudo do genoma funcional. A hibridização diferencial de genes representados por os ESTs de cDNA, com sondas obtidas a partir de micélio vegetativo de T. reesei, cultivado em meio com distinta fonte de carbono (celulose, glicose ou soforose), nos permitirá avaliar a expressão gênica em resposta da variação metabólica e identificar os genes expressos ou reprimidos nessas condições, usando a tecnologia de microarray. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ALCALDE, Felipe Santiago Chambergo. Elucidação do destino metabólico de glicose no fungo filamentoso Trichoderma reesei por análise EST (Expressed Sequence Tags) e microarrays de cDNA.. 2002. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.