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Estudos estruturais e funcionais das proteínas reguladoras Ki-1/57 e Rack-1 e do complexo entre as duas

Processo: 04/13295-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Data de Início da vigência: 01 de março de 2005
Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2009
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Jörg Kobarg
Beneficiário:Gustavo Costa Bressan
Instituição Sede: Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Síncrotron (ABTLuS). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Elementos estruturais de proteínas   Interferência de RNA   Espectrometria de massas
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Cgi-55 | Espectrometria De Massa | Ki-1/57 | Rack-1 | Rna De Interferencia | Selex

Resumo

A proteína humana Ki-1/57 foi primeiramente identificada a partir da reação cruzada com anticorpo monoclonal Ki-1 em células do linfoma de Hodgkin e possui características de oncoproteína. A partir da busca em bancos de dados, encontramos a proteína homóloga a Ki-1/57, CGI-55. Essa proteína foi descrita por ligar-se ao mRNA da proteína PAI 1 mas ainda possui função desconhecida. Ki-1/57 também foi descrita interagir com RNA, embora com menor intensidade que a hialuronatos intracelulares. Através de análises de duplo híbrido, descobrimos várias proteínas que interagem com essas duas proteínas. Mostramos que CGI-55 se associa com corpos de Cajal, regiões nucleares envolvidas em processamento de RNA e/ou regulação da transcrição. Além de várias outras proteínas, a proteína Ki-1/57 interage com a proteína adaptadora RACK-1. Essa proteína é envolvida em sinalização celular e pode modificar prováveis funções de Ki-1/57. Nesse projeto, estudaremos a estrutura e função das proteínas Ki-1/57 e RACK-1. A técnica SELEX será utilizada para identificar RNAs ligantes à proteína Ki-1/57 e possivelmente a CGI-55. Serão obtidas linhagens de células humanas com o gene de Ki- 1/57 silenciado para estudos funcionais. Identificaremos proteínas que interagem com Ki-1/57 fosforilada e seus aminoácidos que sofrem fosforilação e/ou metilação. Estudos espectroscópicos e-biofísicos do complexo Ki-1/57 e RACK-1 serão realizados. As duas proteínas também serão purificadas para ensaios de cristalização e análises estruturais. (AU)

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Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
BRESSAN, Gustavo Costa. Ki-1/57 e uma proteina intrinsecamente desordenada envolvida em mecanismos de regulação genica. 2009. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.