Métodos de armazenamento da amostra ruminal para estudos microbiológicos e metabolismo ruminal de novilhos nelore alimentados com glicerina associado ao óleo

Autor(es)

Yury Tatiana Granja Salcedo

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: Jaboticabal. 2017-04-06.
• Instituição: Universidade Estadual Paulista (Unesp). Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Jaboticabal
• Data de defesa: 2017-02-21
• Orientador: Telma Teresinha Berchielli; Juliana Duarte Messana

Resumo

O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito de três métodos e quatro tempos de armazenamento da amostra ruminal, sobre a qualidade e rendimento do DNA metagenômico extraído assim como o efeito sobre a composição da comunidade bacteriana ruminal e avaliar o efeito da glicerina bruta (CG) associada ao óleo de soja (OS) na dieta de Novilhos Nelore sobre o consumo, digestibilidade, fermentação, biohidrogenação (BH), microbiota ruminal e fluxo intestinal de ácidos graxos de cadeia longa. No experimento 1 utilizou-se um novilho Nelore equipado com cânula ruminal de silicone como doador de conteúdo ruminal e compreendeu 11 tratamentos: pellet controle (PC), liofilizado controle (LC), P-20: pellet armazenado a -20 ° C por um período de 3, 6 e 12 meses, P-80: pellet armazenado a -80 ° C durante um período de 3, 6 e 12 meses e L-20: amostra liofilizada armazenada a -20 ° C durante um período de 3, 6 e 12 meses. O método L-20 não conseguiu manter o rendimento de DNA durante o armazenamento. O método P-80 apresentou maior rendimento de DNA após 6 meses de armazenamento. Amostras armazenados como pellets (P-20 e P-80) resultaram em menor riqueza Chao 1, ACE e índice Shannon Wiener quando comparado com PC. Enquanto LC e PC apenas foram diferentes na riqueza ACE. O método de armazenamento e tempo de armazenamento influenciou as proporções de 14 ds 17 filos identificado. No método P-20 a proporção de Cianobactérias, Elusimicrobia, Fibrobacteres, Lentisphaerae, Proteobacteria e Espiroquetas foi menor ao 1%. No método P-80, houve um aumento na proporção do filo Bacteroides (p = 0,010); No entanto, a proporção de Actinobactérias, Chloroflexi, SR1, Synergistetes, TM7, e WPS.2 não mudou quando comparados com PC (p> 0,05). A classe Clostridium foi a mais abundante em todas as amostras armazenadas e aumento especialmente no método L-20. O tempo de armazenamento da amostra rúmen reduz significativamente o rendimento de DNA extraído e pode influenciar a abundância de filos, classes, e as famílias bacterianas estudadas assim como os índices de riqueza e diversidade. No experimento 2: oito Nelore castrados e equipados com cânula ruminal e duodenal foram utilizados em um duplo, quadrado latino 4 × 4 com um arranjo fatorial 2 × 2 (com ou sem SO e com ou sem CG). Animais alimentados com SO sem CG apresentaram menor consumo de MS, CP e FDN e apresentaram a menor digestibilidade de MS e FDN. Foi observado um maior fluxo duodenal de ácidos graxos (FA) monoinsaturados (MUFA), FA poli-insaturados (PUFA) e FA insaturados (UFA) com associação CG e SO na dieta. Houve interação entre CG e SO na taxa de BH ruminal de PUFA, UFA e ácido linolênico, observando-se menor BH com a associação CG e SO, quando comparado com a dieta SO sem CG. Esta interação também foi observada na taxa de BH de MUFA, que foi menor com associação CG e SO. Os novilhos alimentados com a associação de óleo e glicerina na dieta apresentaram maior pH ruminal e menor concentração de N-NH3 ruminal. Dietas com adição de CG reduziram a relação acetato: propionato e aumentaram a proporção de iso-butirato, butirato, iso-valerato e valerato. Novilhos alimentados com dietas contendo SO apresentaram menor excreção de N total e maior retenção de N, expressa em % da ingestão de N. A associação de SO e CG na dieta gerou maior abundância ruminal de Prevotella, Succinivibrio, Ruminococcus, Syntrophococcus e Succiniclasticum. A abundância de Archaea e protozoários ciliados totais foi menor nos animais alimentados com dietas contendo SO. A dieta SO sem CG reduziu a população ruminal de Ruminococcus flavefaciens, R. albus e Fibrobacter succinogenes. CG associada a SO pode ser fonte de energia, útil para a substituição parcial do milho na dieta de bovinos, resultando na redução da excreção total de N e efeitos negativos na abundância de metanogenicos ruminais, sem afetar a ingestão e digestibilidade da dieta, mesmo quando alto teor de lipídios foi adicionado na dieta. Além disso, esta associação limitou a BH de UFA e aumentou o fluxo duodenal destes ácidos sem influenciar as bactérias celulolíticas do rúmen; por tanto, esta associação pode ser uma estratégia nutricional para aumentar a deposição de UFA saudável na carne. (AU)

• Processo FAPESP: 13/23851-6 - Métodos de extração de DNA para o estudo da população microbiana ruminal em bovinos alimentados com glicerina associado ao óleo
• Beneficiário: Yury Tatiana Granja Salcedo
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado