Diversidade na arquitetura e expressão gênica: uma análise quantitativa de Exon shuffling e splicing alternativo

Autor(es)

Fabio Passetti

• Tipo de documento: Dissertação de Mestrado
• Imprenta: São Paulo. , gráficos, ilustrações.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ)
• Data de defesa: 2002-06-20

Membros da banca

Sandro José de Souza; Sergio Verjovski Almeida; Paolo Marinho de Andrade Zanotto

• Orientador: Sandro José de Souza
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica
• Indexada em: Banco de Dados Bibliográficos da USP-DEDALUS
• Localização: Universidade de São Paulo. Biblioteca do Conjunto das Químicas; CQ T/547.88; P287d

Resumo

A função e a arquitetura dos genes está começando a ser elucidada a partir do estudo de genomas completos tanto de procariotos como de eucariotos. Diversos estudos foram ultimamente realizados a respeito de exon shuffling do ponto de vista evolutivo, fenômeno relacionado à origem de novos genes através de recombinações de DNA mediadas por introns. Apesar de eventos de exon shuffling serem responsáveis pelo aumento da modularidade gênica, outros processos foram desenvolvidos ao longo da evolução para que houvesse o aumento da diversidade do proteoma sem a conseqüente expansão dos genomas, sendo splicing alternativo um dos mais freqüentes. Apresentamos nesta dissertação duas extensivas análises: 1) a análise de uma base de dados de genes eucarióticos contendo pelo menos um intron que apresentou excesso de introns de fase 0 e exons simétricos, dados que suportam exon shuffling como um importante mecanismo de evolução gênica. Avaliamos também a confiabilidade de introns preditos por programas de computador através de alinhamento de ESTs; e 2) a análise do uso alternativo de exons (UAE), um tipo de splicing alternativo, em transcritos humanos detectando que cerca de 51% dos genes humanos possuem mais de uma variante de splicing e que este tipo de processamento pós-transcricional parece ser mais freqüentemente encontrado em tecidos tumorais. (AU)

• Processo FAPESP: 00/02228-9 - Uma análise quantitativa do papel de éxon shuffling durante a evolução: uma abordagem genômica
• Beneficiário: Fabio Passetti
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado