Molecular technologies in the study of periodontal diseases

Autor(es)

Tiago Taiete

• Tipo de documento: Dissertação de Mestrado
• Imprenta: Piracicaba, SP.
• Instituição: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Odontologia de Piracicaba
• Data de defesa: 2013-06-03

Membros da banca

Marcio Zaffalon Casati; Renato Corrêa Viana Casarin; Fernanda Vieira Ribeiro

• Orientador: Marcio Zaffalon Casati

Resumo

A periodontite agressiva é caraterizada por apresentar início precoce, rápida progressão e pobre resposta as abordagens terapêuticas quando comparado a periodontite crônica. Entretanto, os mecanismos responsáveis por essas diferenças ainda não são completamente compreendidos. Ferramentas como a genômica, proteômica ou transcriptômica podem esclarecer esses aspectos, gerando importantes informações a respeito da patogênese das doenças periodontais. Portanto, os objetivos do presente estudo foram: i) Apresentar uma revisão de literatura focada na aplicação da genômica, transcriptômica, proteômica e metabolômica no estudo das doenças periodontais. ii) Avaliar as diferenças no perfil de expressão gênica da mucosa mastigatória, sem a influência do biofilme subgengival, em indivíduos com histórico de periodontite agressiva e crônica, comparando-os entre si e também com o perfil de expressão de indivíduos sem histórico de periodontite visando à identificação de possíveis alterações constitutivas na expressão de genes que podem estar relacionadas com as diferenças entre as duas formas de periodontite. Para o primeiro objetivo, foi realizada uma revisão dos artigos que empregaram as tecnologias ômicas no estudo das doenças periodontais. Os estudos presentes na literatura indicaram que essas tecnologias podem levar a um melhor entendimento dos eventos moleculares envolvidos na patogênese das doenças periodontais. Para o segundo objetivo, foram obtidas amostras teciduais da mucosa mastigatória de 4 pacientes com histórico de periodontite crônica, 4 com periodontite agressiva generalizada e 4 indivíduos sem histórico de periodontite. As amostras foram manipuladas para a extração de RNA total, síntese de cDNA de fita dupla e a hibridização por microarranjo de DNA, avaliando a expressão de 45033 genes. Os programas R e Bioconductor foram empregados para realizar a análise de RMA (Robust-Multi-Array), calcular o valor de expressão (fold-change) e o valor de p para comparações múltiplas através do método de Benjamini-Hochberg. O enriquecimento dos dados, através de ontologia gênica e análise de via, foi realizado com o programa de bioinformática DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery). Três comparações foram realizadas: comparação 1 (periodontite agressiva x indivíduos sem histórico de periodontite); comparação 2 (periodontite crônica x indivíduos sem histórico de periodontite); e comparação 3 (periodontite crônica x periodontite agressiva). A comparação entre os grupos identificou: 192 genes e 50 grupos diferencialmente expressos na comparação 1, 43 genes e 27 grupos na comparação 2 e 168 genes e 75 grupos na comparação 3. Genes com funções no sistema imune, entre os quais receptores de linfócitos natural killer, foram mais expressos em periodontite agressiva; em contraste, genes envolvidos na proliferação e diferenciação de queratinócitos, assim como genes com função em processos neurais foram menos expressos. Já os indivíduos com periodontite crônica se caracterizaram por um aumento na expressão de genes com função na resposta a estímulos externos, e uma diminuição na expressão dos genes relacionados ao sistema imune. Dentro dos limites desse estudo, pode-se concluir que existem diferenças nos perfis de expressão gênica da mucosa mastigatória de indivíduos com histórico de periodontite agressiva e crônica, quando comparadas entre si e com indivíduos sem histórico de periodontite, que podem estar associadas às diferenças em suas patogêneses (AU)

• Processo FAPESP: 11/03625-6 - Perfil de expressão gênica em tecido da mucosa mastigatória de pacientes com histórico de periodontite crônica e agressiva
• Beneficiário: Tiago Taiete
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado