Canalização: fenótipos robustos como consequência de características da rede de regulação gênica

Autor(es)

Vitor Hugo Louzada Patricio

• Tipo de documento: Dissertação de Mestrado
• Imprenta: São Paulo.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME/SBI)
• Data de defesa: 2011-04-20

Membros da banca

Ronaldo Fumio Hashimoto; Tie Koide; Ney Lemke

• Orientador: Ronaldo Fumio Hashimoto

Resumo

Em sistemas biológicos, o estudo da estabilidade das redes de regulação gênica é visto como uma contribuição importante que a Matemática pode proporcionar a pesquisas sobre câncer e outras doenças genéticas. Neste trabalho, utilizamos o conceito de ``canalização\'\' como sinônimo de estabilidade em uma rede biológica. Como as características de uma rede de regulação canalizada ainda são superficialmente compreendidas, estudamos esse conceito sob o ponto de vista computacional: propomos um modelo matemático simplificado para descrever o fenômeno e realizamos algumas análises sobre o mesmo. Mais especificamente, a estabilidade da maior bacia de atração das redes Booleanas - um clássico paradigma para a modelagem de redes de regulação - é analisada. Os resultados indicam que a estabilidade da maior bacia de atração está relacionada com dados biológicos sobre o crescimento de colônias de leveduras e que considerações sobre a interação entre as funções Booleanas e a topologia da rede devem ser realizadas conjuntamente na análise de redes estáveis. (AU)

• Processo FAPESP: 09/03124-7 - Identificando genes canalizadores usando redes booleanas probabilísticas contextuais
• Beneficiário: Vitor Hugo Louzada Patricio
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado