CV Lattes
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Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP) (Instituição-sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Brasil
Graduated in Biology from UNESP State University São Paulo, Brazil (1980-83), Master MSc (1984-86) and PhD (1986-88) in Biochemistry from Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, USP, Brazil. His postdoctoral studies were conducted at the Molecular Genetics Institute of Montpellier (CNRS, Montpellier, France), (1992-94). Then he worked during several years (1997-2017) in close collaboration at INSERM U1090 in Marseille (France) studying the large scale gene expression (transcriptome) of the mouse thymus gland. Currently he is Associate Professor (Genetics and Molecular Biology) at School of Dentistry and Ribeirão Preto Medical School University of São Paulo, Campus of Ribeirão Preto, Brazil. He is the coordinator of the Molecular Immunogenetics Group (http://sites.usp.br/imunogenetica/), whose research lab is located at Department of Genetics, Ribeirão Preto Medical School, USP. He is the coordinator of the FAPESP Thematic Project Using Crispr-Cas9 System to Edit the Aire Gene in mTEC Cells. Member of the Board of Academic Editors of Frontiers in Immunology and he is the co-Editor-in-Chief of Critical Reviews in Immunology and the editor of the book Thymus Transcriptome and Cell Biology (https://www.springer.com/us/book/9783030120399) published in 2019 by Springer Nature Switzerland AG. He has experience on molecular genetics, focusing mainly on the following topics: functional genomics (transcriptome analysis of mRNAs, miRNAs and lncRNAs) of the immune system (Aire gene, transcriptome profiling, induction of indel mutations in the Aire gene by using CRISPR-Cas9, microRNAs and autoimmunity). He also works on projects on gene expression regulation during osteoblastic differentiation of mesenchymal stem cells isolated from human dental pulp. He was the adviser of two PhD theses awarded by CAPES Ministry of Education (2008 CAPES Thesis Award and 2010 CAPES Thesis Honor in Genetics). (Fonte: Currículo Lattes)
O gene Autoimmune regulator (Aire) (cromossomo 21q22.3 humano e 10qC1 murino Mus musculus) é um controlador da tolerância imunológica central e do surgimento de doenças autoimunes. Aire apresenta ~80% de similaridade homem-camundongo e regula a transcrição de genes de autoantígenos de tecidos periféricos (PTAs do inglês peripheral tissue antigens) em células tímicas epiteliais medulares (…
O timo desempenha seu papel na indução da tolerância imunológica central aos antígenos relacionados aos tecidos próprios (TRAs) sendo que na medula desse órgão, nas células tímicas medulares epiteliais (mTECs) ocorre a expressão de centenas desses TRAs que, por sua vez, representam virtualmente todos os órgãos e tecidos do corpo. Devido à diversidade de representação, este fenômeno foi ch…
O projeto atual está inserido na linha de genética molecular do diabetes melitus do tipo 1 (DM-1), do tipo 2 (DM-2) e gestacional (DMG) e refere-se ao estudo comparativo da expressão gênica em grande escala (transcriptoma) nessas três variantes da doença. O DM- 1 tem característica autoimune devido à destruição das células beta do pâncreas, ocasionando dependência à insulina. A doença tem…
O projeto atual está dentro da linha de genética molecular da tolerância imunológica e refere-se ao estudo do controle da expressão gênica promíscua (PGE) de antígenos relacionados a tecidos (TRAs) em células medulares do epitélio tímico (mTECs). A observação de que células mTEC expressam milhares de antígenos representando a maioria, se não todos, os tecidos e órgãos, fenômeno este denom…
O (a) bolsista estudará o perfil transcricional envolvendo mRNAs e miRNAs de timócitos que interagem fisicamente com células mTECs Aire wild-type (wt) ou Aire mutantes (adesão mTECs-timócitos em cultura in vitro). Como já discutido no projeto geral, a interação entre timócitos e as células tímicas epiteliais (TECs) é essencial para o desenvolvimento desses dois tipos celulares. Para testa…
A bolsista de IC trabalhará junto aos pós-graduandos e pós-doutorandos do projeto sob a orientação do supervisor. Ela fará uso do sistema CRISPR-Cas9 para induzir mutações no gene Aire, as mesmas associadas com a síndrome APS1 em células mTEC linhagem 3.10. Faremos a seleção das mutações do gene Aire humano (domínios SAND e PHD) para desenhar o RNA guia (gRNA) do sistema CRISPR-Cas9, segu…
O gene Autoimmune regulator (Aire) (cromossomo 21q22.3 humano e 10qC1 murino Mus musculus), é um controlador da tolerância imunológica central e do surgimento de doenças autoimunes. A sequência de Aire apresenta ~80% de similaridade homem-camundongo e este gene regula a transcrição de genes de autoantígenos de tecidos periféricos (PTAs do inglês peripheral tissue antigens) em células tími…
O projeto atual está inserido na linha de genética molecular do diabetes mellitus do tipo 1 (DM-1), do tipo 2 (DM-2) e gestacional (DMG) e refere-se ao estudo comparativo da expressão gênica em grande escala (transcriptoma) nessas três variantes da doença. O DM-1 tem característica auto-imune devido à destruição das células beta do pâncreas, ocasionando dependência à insulina. A doença te…
O projeto atual está inserido na linha de genética molecular do Diabetes Mellitus do tipo 1 (DM-1), do tipo 2 (DM-2) e gestacional (DMG) e refere-se ao estudo comparativo da expressão gênica em grande escala (transcriptoma) nessas três variantes da doença. O DM-1 tem característica autoimune devido à destruição das células beta do pâncreas, ocasionando dependência à insulina. A doença tem…
Este projeto refere-se ao estudo comparativo, entre linhagens isogênicas de camundongos (Balb-c, C57BL/6 e CBA), da emergência da recombinação V(D)J de TCRVB8.1 relacionando com a expressão gênica diferencial que ocorre no timo à época dos rearranjos gênicos. O objetivo é estabelecer um paralelo entre a época da recombinação com a rede de expressão gênica que a controla. Em nosso laborató…
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
| Publicações | 21 |
| Citações | 251 |
| Cit./Artigo | 12,0 |
| Dados do Web of Science | |
PEREIRA‚ E.; TAMIA-FERREIRA‚ M.C.; CARDOSO‚ R.S.; MELLO‚ S.S.; SAKAMOTO-HOJO‚ E.T.; PASSOS‚ G.A.S.; DONADI‚ E.A.. Immunosuppressive therapy modulates T lymphocyte gene expression in patients with systemic lupus erythematosus. Immunology, v. 113, n. 1, p. 99-105, 2004. (99/12135-9)
SOUSA CARDOSO‚ R.; MAGALHÃES‚ D.A.R.; BAIÃO‚ A.M.T.; JUNTA‚ C.M.; MACEDO‚ C.; MARQUES‚ M.; SAKAMOTO-HOJO‚ E.T.; DONADI‚ E.A.; PASSOS‚ G.A.S.. Onset of promiscuous gene expression in murine fetal thymus organ culture. Immunology, v. 119, n. 3, p. 369-375, 2006. (99/12135-9)
SAKAMOTO-HOJO, E. T.; PEREIRA, E.; FACHIN, A. L.; CARDOSO, R. S.; DONADI, E. A.; PASSOS, G. A. S.; MELLO, S. S.; JUNTA, C. M.. Gene expression profiles in human cells submitted to genotoxic stress. MUTATION RESEARCH-REVIEWS IN MUTATION RESEARCH, v. 544, n. 2-3, p. 403-413, Nov. 2003. (00/01005-6, 00/09063-5, 02/01441-6, 01/10995-2, 01/09519-1, 99/12135-9)
MAGALHÃES, DANIELLE A. R.; MACEDO, CLAUDIA; JUNTA, CRISTINA M.; MELLO, STEPHANO S.; MARQUES, MÁRCIA M. C.; CARDOSO, RENATO S.; SAKAMOTO-HOJO, ELZA T.; DONADI, EDUARDO A.; PASSOS, GERALDO A. S.. Hybridization signatures during thymus ontogeny reveals modulation of genes coding for T-cell signaling proteins. Molecular Immunology, v. 42, n. 9, p. 1043-1048, May 2005. (99/12135-9, 01/08278-0)
MANOEL-CAETANO, FERNANDA S.; XAVIER, DANILO J.; EVANGELISTA, ADRIANE F.; TAKAHASHI, PAULA; COLLARES, CRISTHIANNA V.; PUTHIER, DENIS; FOSS-FREITAS, MARIA C.; FOSS, MILTON C.; DONADI, EDUARDO A.; PASSOS, GERALDO A.; et al. Gene expression profiles displayed by peripheral blood mononuclear cells from patients with type 2 diabetes mellitus focusing on biological processes implicated on the pathogenesis of the disease. Gene, v. 511, n. 2, p. 151-160, DEC 15 2012. Citações Web of Science: 26. (10/00932-2, 10/05622-1, 10/12069-7, 08/56594-8)
PEZZI, NICOLE; ASSIS, AMANDA FREIRE; COTRIM-SOUSA, LARISSA COTRIM; LOPES, GABRIEL SARTI; MOSELLA, MARITZA SALAS; LIMA, DJALMA SOUSA; BOMBONATO-PRADO, KARINA F.; PASSOS, GERALDO ALEIXO. Aire knockdown in medullary thymic epithelial cells affects Aire protein, deregulates cell adhesion genes and decreases thymocyte interaction. Molecular Immunology, v. 77, p. 157-173, SEP 2016. Citações Web of Science: 5. (13/17481-1)
PASSOS, GERALDO ALEIXO; MENDES-DA-CRUZ, DANIELLE AREAS; OLIVEIRA, ERNNA HERIDA. The thymic orchestration involving Aire, miRNAs, and cell-cell interactions during the induction of central tolerance. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 6, JUL 14 2015. Citações Web of Science: 13. (13/08216-2, 13/17481-1)
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MENDES-DA-CRUZ, DANIELLA A.; LEMOS, JULIA P.; PASSOS, GERALDO A.; SAVINO, WILSON. Abnormal T-Cell Development in the Thymus of Non-obese Diabetic Mice: Possible Relationship With the Pathogenesis of Type 1 Autoimmune Diabetes. FRONTIERS IN ENDOCRINOLOGY, v. 9, JUL 12 2018. Citações Web of Science: 3. (13/17481-1)
OLIVEIRA, ERNNA H.; MACEDO, CLAUDIA; COLLARES, CRISTHIANNA V.; FREITAS, ANA CAROLINA; DONATE, PAULA BARBIM; SAKAMOTO-HOJO, ELZA T.; DONADI, EDUARDO A.; PASSOS, GERALDO A.. Aire Downregulation Is Associated with Changes in the Posttranscriptional Control of Peripheral Tissue Antigens in Medullary Thymic Epithelial Cells. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 7, NOV 23 2016. Citações Web of Science: 4. (13/17481-1, 08/56594-8)
DERNOWSEK, JANAINA A.; PEREIRA, MILENA C.; FORNARI, THAIS A.; MACEDO, CLAUDIA; ASSIS, AMANDA F.; DONATE, PAULA B.; BOMBONATO-PRADO, KARINA F.; PASSOS-BUENO, MARIA RITA; PASSOS, GERALDO A.. Posttranscriptional Interaction Between miR-450a-5p and miR-28-5p and STAT1 mRNA Triggers Osteoblastic Differentiation of Human Mesenchymal Stem Cells. Journal of Cellular Biochemistry, v. 118, n. 11, p. 4045-4062, NOV 2017. Citações Web of Science: 9. (07/57658-7)
MACEDO, CLAUDIA; OLIVEIRA, ERNNA H.; ALMEIDA, RENATA S.; DONATE, PAULA B.; FORNARI, THAIS A.; PEZZI, NICOLE; SAKAMOTO-HOJO, ELZA T.; DONADI, EDUARDO A.; PASSOS, GERALDO A.. Aire-dependent peripheral tissue antigen mRNAs in mTEC cells feature networking refractoriness to microRNA interaction. Immunobiology, v. 220, n. 1, p. 93-102, JAN 2015. Citações Web of Science: 10. (13/08216-2, 13/17481-1, 08/56594-8)
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COLLARES, C. V. A.; EVANGELISTA, A. F.; XAVIER, D. J.; TAKAHASHI, P.; ALMEIDA, R.; MACEDO, C.; MANOEL-CAETANO, F.; FOSS, M. C.; FOSS-FREITAS, M. C.; RASSI, D. M.; et al. Transcriptome meta-analysis of peripheral lymphomononuclear cells indicates that gestational diabetes is closer to type 1 diabetes than to type 2 diabetes mellitus. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, v. 40, n. 9, p. 5351-5358, SEP 2013. Citações Web of Science: 10. (10/00932-2, 10/05622-1, 10/12069-7, 08/56594-8)
EVANGELISTA, ADRIANE F.; COLLARES, CRISTHIANNA V. A.; XAVIER, DANILO J.; MACEDO, CLAUDIA; MANOEL-CAETANO, FERNANDA S.; RASSI, DIANE M.; FOSS-FREITAS, MARIA C.; FOSS, MILTON C.; SAKAMOTO-HOJO, ELZA T.; NGUYEN, CATHERINE; et al. Integrative analysis of the transcriptome profiles observed in type 1, type 2 and gestational diabetes mellitus reveals the role of inflammation. BMC MEDICAL GENOMICS, v. 7, MAY 23 2014. Citações Web of Science: 16. (10/00932-2, 10/05622-1, 10/12069-7, 08/56594-8)
XAVIER, DANILO J.; TAKAHASHI, PAULA; MANOEL-CAETANO, FERNANDA S.; FOSS-FREITAS, MARIA C.; FOSS, MILTON C.; DONADI, EDUARDO A.; PASSOS, GERALDO A.; SAKAMOTO-HOJO, ELZA T.. One-week intervention period led to improvements in glycemic control and reduction in DNA damage levels in patients with type 2 diabetes mellitus. Diabetes Research and Clinical Practice, v. 105, n. 3, p. 356-363, SEP 2014. Citações Web of Science: 6. (10/00932-2, 10/12069-7, 08/56594-8)
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SPECK-HERNANDEZ, CESAR A.; ASSIS, AMANDA F.; FELICIO, RAFAELA F.; COTRIM-SOUSA, LARISSA; PEZZI, NICOLE; LOPES, GABRIEL S.; BOMBONATO-PRADO, KARINA F.; GIULIATTI, SILVANA; PASSOS, GERALDO A.. Aire Disruption Influences the Medullary Thymic Epithelial Cell Transcriptome and Interaction With Thymocytes. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 9, MAY 7 2018. Citações Web of Science: 3. (13/17481-1)
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TAKAHASHI, PAULA; XAVIER, DANILO J.; EVANGELISTA, ADRIANE F.; MANOEL-CAETANO, FERNANDA S.; MACEDO, CLAUDIA; COLLARES, CRISTHIANNA V. A.; FOSS-FREITAS, MARIA C.; FOSS, MILTON C.; RASSI, DIANE M.; DONADI, EDUARDO A.; et al. MicroRNA expression profiling and functional annotation analysis of their targets in patients with type 1 diabetes mellitus. Gene, v. 539, n. 2, p. 213-223, APR 15 2014. Citações Web of Science: 30. (10/00932-2, 10/05622-1, 10/12069-7, 08/56594-8)
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FACHIN, ANA LUCIA; MELLO, STEPHANO SPANO; SANDRIN-GARCIA, PAULA; JUNTA, CRISTINA MORAES; GHILARDI-NETTO, THOMAZ; DONADI, EDUARDO ANTONIO; DA SILVA PASSOS, GERALDO ALEIXO; SAKAMOTO-HOJO, ELZA TIEMI. Gene Expression Profiles in Radiation Workers Occupationally Exposed to Ionizing Radiation. JOURNAL OF RADIATION RESEARCH, v. 50, n. 1, p. 61-71, JAN 2009. Citações Web of Science: 43. (02/07314-6, 99/12135-9, 01/10995-2)
DA SILVA‚ M.I.; PASSOS‚ G.A.S.. The human immunoglobulin variable lambda locus IGLV9 gene is a monomorphic marker in the urban Brazilian population. Immunology Letters, v. 69, n. 3, p. 369-370, 1999. (98/05584-9, 98/09789-4)
MORAES JUNTA‚ C.; PASSOS‚ G.A.S.. Genomic EcoRI polymorphism and cosmid sequencing reveal an insertion/deletion and a new IGLV5 allele in the human immunoglobulin lambda variable locus (22q11. 2/IGLV). IMMUNOGENETICS, v. 55, n. 1, p. 10-15, 2003. (98/05584-9, 98/09789-4, 96/07847-1)
FORNARI, THAIS A.; DONATE, PAULA B.; ASSIS, AMANDA F.; MACEDO, CLAUDIA; SAKAMOTO-HOJO, ELZA T.; DONADI, EDUARDO A.; PASSOS, GERALDO A.. Comprehensive Survey of miRNA-mRNA Interactions Reveals That Ccr7 and Cd247 (CD3 zeta) are Posttranscriptionally Controlled in Pancreas Infiltrating T Lymphocytes of Non-Obese Diabetic (NOD) Mice. PLoS One, v. 10, n. 11, NOV 25 2015. Citações Web of Science: 11. (13/08216-2, 08/56594-8)
XAVIER, DANILO J.; TAKAHASHI, PAULA; EVANGELISTA, ADRIANE F.; FOSS-FREITAS, MARIA C.; FOSS, MILTON C.; DONADI, EDUARDO A.; PASSOS, GERALDO A.; SAKAMOTO-HOJO, ELZA T.. Assessment of DNA damage and mRNA/miRNA transcriptional expression profiles in hyperglycemic versus non-hyperglycemic patients with type 2 diabetes mellitus. MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS, v. 776, n. SI, p. 98-110, JUN 2015. Citações Web of Science: 11. (10/12069-7, 08/56594-8)
SPECK-HERNANDEZ, CESAR A.; ASSIS, AMANDA F.; FELICIO, RAFAELA F.; COTRIM-SOUSA, LARISSA; PEZZI, NICOLE; LOPES, GABRIEL S.; BOMBONATO-PRADO, KARINA F.; GIULIATTI, SILVANA; PASSOS, GERALDO A.. Aire Disruption Influences the Medullary Thymic Epithelial Cell Transcriptome and Interaction With Thymocytes. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 9, MAY 7 2018. Citações Web of Science: 3. (13/17481-1)
COTRIM-SOUSA, LARISSA; FREIRE-ASSIS, AMANDA; PEZZI, NICOLE; TANAKA, PEDRO PARANHOS; OLIVEIRA, ERNNA HERIDA; PASSOS, GERALDO ALEIXO. Adhesion between medullary thymic epithelial cells and thymocytes is regulated by miR-181b-5p and miR-30b. Molecular Immunology, v. 114, p. 600-611, OCT 2019. Citações Web of Science: 1. (13/17481-1, 17/10780-4)
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OLIVEIRA, ERNNA H.; ASSIS, AMANDA F.; SPECK-HERNANDEZ, CESAR A.; DUARTE, MAX JORDAN; PASSOS, GERALDO A.. Aire Gene Influences the Length of the 3 ` UTR of mRNAs in Medullary Thymic Epithelial Cells. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 11, MAY 28 2020. Citações Web of Science: 0. (13/17481-1, 17/10780-4)
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
OLIVEIRA, Ernna Hérida Domingues de. Vias de regulação da expressão gênica promíscua no timo envolve Aire e microRNAs. Tese (Doutorado) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto. (09/54694-8)
TAVARES, Thais Arouca Fornari. Análise da expressão gênica promíscua no timo de camundongos NOD (non obese diabetic) durante a emergência do Diabetes melitus tipo 1. Dissertação (Mestrado) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto. (05/57231-8)
CARDOSO, Renato Sousa. Avaliação dos efeitos da radiação gama na expressão de genes reguladores da recombinação V(D)J de receptores de células T. 172 f. Tese (Doutorado) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto. (00/09994-9)
MAGALHÃES, Danielle Aparecida Rosa de. Análise do transcriptoma durante a ontogenia do timo.. Tese (Doutorado) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto. (03/00982-6)
ESPANHOL, Aline Renata. Cinética da expressão gênica diferencial durante a ontogenia do timo. 73 f. Dissertação (Mestrado) - Centro de Ciências Biológicas e da Saúde. Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos. (00/01705-8)