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Geraldo Aleixo da Silva Passos Júnior
CV Lattes
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Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP) (Instituição-sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Brasil
Graduated in Biology from UNESP State University São Paulo, Brazil (1980-83), Master MSc (1984-86) and PhD (1986-88) in Biochemistry from Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, USP, Brazil. His postdoctoral studies were conducted at the Molecular Genetics Institute of Montpellier (CNRS, Montpellier, France), (1992-94). Then he worked during several years (1997-2017) in close collaboration at INSERM U1090 in Marseille (France) studying the large scale gene expression (transcriptome) of the mouse thymus gland. Currently he is Associate Professor (Genetics and Molecular Biology) at School of Dentistry and Ribeirão Preto Medical School University of São Paulo, Campus of Ribeirão Preto, Brazil. He is the coordinator of the Molecular Immunogenetics Group (http://sites.usp.br/imunogenetica/), whose research lab is located at Department of Genetics, Ribeirão Preto Medical School, USP. He is the coordinator of the FAPESP Thematic Project "Using Crispr-Cas9 System to Edit the Aire Gene in mTEC Cells". Member of the Board of Academic Editors of Frontiers in Immunology. Is the editor of the book "Thymus Transcriptome and Cell Biology" (https://www.springer.com/us/book/9783030120399) published in 2019 by Springer Nature Switzerland AG. He has experience on molecular genetics, focusing mainly on the following topics: functional genomics (transcriptome analysis of mRNAs, miRNAs and lncRNAs) of the immune system (Aire gene, transcriptome profiling, induction of indel mutations in the Aire gene by using CRISPR-Cas9, microRNAs and autoimmunity). He also works on projects on gene expression regulation during osteoblastic differentiation of mesenchymal stem cells isolated from human dental pulp. He was the adviser of two PhD theses awarded by CAPES Ministry of Education (2008 CAPES Thesis Award and 2010 CAPES Thesis Honor in Genetics). (Fonte: Currículo Lattes)
Auxílios à pesquisa
- Efeito de mutações no gene AIRE (síndrome APS1) induzidas por CRISPR-Cas9 na conformação da proteína, no transcriptoma de células mTEC e na sua interação com timócitos, AP.TEM
Resumo
O gene Autoimmune regulator (Aire) (cromossomo 21q22.3 humano e 10qC1 murino Mus musculus), é um controlador da tolerância imunológica central e do surgimento de doenças autoimunes. Aire apresenta ~80% de similaridade homem-camundongo e regula a transcrição de genes de autoantígenos de tecidos periféricos (PTAs do inglês peripheral tissue antigens) em células tímicas epiteliais medular...
- A função do gene AIRE e de micro RNAs no controle da adesão de células tímicas epiteliais medulares com timócitos, AP.R
Resumo
O timo desempenha seu papel na indução da tolerância imunológica central aos antígenos relacionados aos tecidos próprios (TRAs) sendo que na medula desse órgão, nas células tímicas medulares epiteliais (mTECs) ocorre a expressão de centenas desses TRAs que, por sua vez, representam virtualmente todos os órgãos e tecidos do corpo. Devido à diversidade de representação, este fenômeno foi...
- Controle do transcriptoma no diabetes mellitus, AP.TEM
Resumo
O projeto atual está inserido na linha de genética molecular do diabetes melitus do tipo 1 (DM-1), do tipo 2 (DM-2) e gestacional (DMG) e refere-se ao estudo comparativo da expressão gênica em grande escala (transcriptoma) nessas três variantes da doença. O DM- 1 tem característica autoimune devido à destruição das células beta do pâncreas, ocasionando dependência à insulina. A doença ...
- Avaliação da ação sinérgica de microRNAs com o gene Aire (autoimmune regulator) no controle da expressão gênica promíscua em células tímicas epiteliais medulares (mTEC), AP.R
Resumo
O projeto atual está dentro da linha de genética molecular da tolerância imunológica e refere-se ao estudo do controle da expressão gênica promíscua (PGE) de antígenos relacionados a tecidos (TRAs) em células medulares do epitélio tímico (mTECs). A observação de que células mTEC expressam milhares de antígenos representando a maioria, se não todos, os tecidos e órgãos, fenômeno este de...
Bolsas no país
- Indução de mutações no gene Aire por meio do sistema CRISPR-Cas9 em células mTEC 3.10, BP.IC
Resumo
A bolsista de IC trabalhará junto aos pós-graduandos e pós-doutorandos do projeto sob a orientação do supervisor. Ela fará uso do sistema CRISPR-Cas9 para induzir mutações no gene Aire, as mesmas associadas com a síndrome APS1 em células mTEC linhagem 3.10. Faremos a seleção das mutações do gene Aire humano (domínios SAND e PHD) para desenhar o RNA guia (gRNA) do sistema CRISPR-Cas9, s...
- Efeito do gene Aire na propriedade quimiotática de células tímicas epiteliais medulares sobre timócitos, BP.IC
Resumo
O gene Autoimmune regulator (Aire) (cromossomo 21q22.3 humano e 10qC1 murino Mus musculus), é um controlador da tolerância imunológica central e do surgimento de doenças autoimunes. A sequência de Aire apresenta ~80% de similaridade homem-camundongo e este gene regula a transcrição de genes de autoantígenos de tecidos periféricos (PTAs do inglês peripheral tissue antigens) em células t...
- Controle do transcriptoma no Diabetes Mellitus, BP.TT
Resumo
O projeto atual está inserido na linha de genética molecular do diabetes mellitus do tipo 1 (DM-1), do tipo 2 (DM-2) e gestacional (DMG) e refere-se ao estudo comparativo da expressão gênica em grande escala (transcriptoma) nessas três variantes da doença. O DM-1 tem característica auto-imune devido à destruição das células beta do pâncreas, ocasionando dependência à insulina. A doença...
- Controle do transcriptoma no Diabetes Mellitus, BP.PD
Resumo
O projeto atual está inserido na linha de genética molecular do Diabetes Mellitus do tipo 1 (DM-1), do tipo 2 (DM-2) e gestacional (DMG) e refere-se ao estudo comparativo da expressão gênica em grande escala (transcriptoma) nessas três variantes da doença. O DM-1 tem característica autoimune devido à destruição das células beta do pâncreas, ocasionando dependência à insulina. A doença ...
Bolsas no Exterior
- Emergência da recombinação V(D)J no locus TCRb e expressão gênica diferencial durante a ontogenia do timo, BE.PQ
Resumo
Este projeto refere-se ao estudo comparativo, entre linhagens isogênicas de camundongos (Balb-c, C57BL/6 e CBA), da emergência da recombinação V(D)J de TCRVB8.1 relacionando com a expressão gênica diferencial que ocorre no timo à época dos rearranjos gênicos. O objetivo é estabelecer um paralelo entre a época da recombinação com a rede de expressão gênica que a controla. Em nosso labor...
Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos
Análise de sequência de DNA
Análise molecular
Anticorpos
Antígenos de neoplasias
Artrite reumatoide
Autoanticorpos
Autoimunidade
Biblioteca gênica
CRISPR-Cas9
Camundongos endogâmicos
Camundongos
Células matadoras naturais
Células-tronco mesenquimais
Ciclofosfamida
Ciências Biológicas
Citocinas
Clonagem
Colágeno
Cosmídeos
DNA complementar
Desenvolvimento fetal
Diabetes mellitus
Diferenciação celular
Doenças autoimunes
Engenharia genética
Expressão gênica diferencial
Expressão gênica
Fatores quimiotáticos
Fragmentação do DNA
Genética Humana e Médica
Genética Molecular e de Microorganismos
Genética molecular
Genética
Genoma Humano do Câncer
Genomas
Genômica
Imunogenética
Imunoglobulinas
Imunologia
Imunossupressão
Inativação gênica
Inflamação
Interferência de RNA
Linfócitos T
Linfócitos
Lúpus eritematoso sistêmico
Maturação
MicroRNAs
Modelos animais de doenças
Neoplasias
Ontogenia
Osteoblastos
Polimorfismo de fragmento de restrição
Polimorfismo genético
Quimiocinas
Reação em cadeia por polimerase (PCR)
Recombinação V(D)J
Recombinação genética
Resposta imune
Saccharomyces cerevisiae
Sequenciamento
Sintenia
Técnicas de genotipagem
Timo
Timócitos
Tolerância imunológica
Transcriptoma
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
| Publicações | 21 |
| Citações | 251 |
| Cit./Artigo | 12,0 |
| Dados do Web of Science | |
SPECK-HERNANDEZ, CESAR A.; ASSIS, AMANDA F.; FELICIO, RAFAELA F.; COTRIM-SOUSA, LARISSA; PEZZI, NICOLE; LOPES, GABRIEL S.; BOMBONATO-PRADO, KARINA F.; GIULIATTI, SILVANA; PASSOS, GERALDO A.. Aire Disruption Influences the Medullary Thymic Epithelial Cell Transcriptome and Interaction With Thymocytes. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 9, MAY 7 2018. Citações Web of Science: 3. (13/17481-1)
BASSI, C. L.; MELLO, S. S.; CARDOSO, R. S.; GODOY, P. D. V.; FACHIN, A. L.; JUNTA, C. M.; SANDRIN-GARCIA, P.; CARLOTTI, C. G.; FALCAO, R. P.; DONADI, E. A.; et al. Transcriptional changes in U343 MG-a glioblastoma cell line exposed to ionizing radiation. HUMAN & EXPERIMENTAL TOXICOLOGY, v. 27, n. 12, p. 919-929, DEC 2008. Citações Web of Science: 14. (99/12135-9, 04/15611-6)
FACHIN, ANA LUCIA; MELLO, STEPHANO SPANO; SANDRIN-GARCIA, PAULA; JUNTA, CRISTINA MORAES; GHILARDI-NETTO, THOMAZ; DONADI, EDUARDO ANTONIO; DA SILVA PASSOS, GERALDO ALEIXO; SAKAMOTO-HOJO, ELZA TIEMI. Gene Expression Profiles in Radiation Workers Occupationally Exposed to Ionizing Radiation. JOURNAL OF RADIATION RESEARCH, v. 50, n. 1, p. 61-71, JAN 2009. Citações Web of Science: 43. (99/12135-9, 02/07314-6, 01/10995-2)
TREVISAN‚ G.L.; RASSI‚ D.M.; BAIÃO‚ A.M.T.; SANDRIN-GARCIA‚ P.; MELLO‚ S.S.; TAMIA-FERREIRA‚ M.C.; JUNTA‚ C.M.; FACHIN‚ A.L.; MARQUES‚ M.; SAKAMOTO-HOJO‚ E.T.; et al. Using cDNA microarrays to identify human CD19+ B cell gene products (ESTs) originated from systemic lupus erythematosus susceptibility loci. AUTOIMMUNITY REVIEWS, v. 5, n. 5, p. 319-323, 2006. (99/12135-9, 00/11793-1)
RASSI‚ D.M.; JUNTA‚ C.M.; FACHIN‚ A.N.A.L.; SANDRIN-GARCIA‚ P.; MELLO‚ S.S.; FERNANDES‚ A.N.A.P.M.; DEGHAIDE‚ N.N.H.S.; FOSS-FREITAS‚ M.C.; FOSS‚ M.C.; SAKAMOTO-HOJO‚ E.T.; et al. Is HLA Class II Profile Relevant for the Study of Large-Scale Differentially Expressed Genes in Type 1 Diabetes Mellitus Patients?. Annals of the New York Academy of Sciences, v. 1079, n. 1, p. 305-309, 2006. (99/12135-9, 01/04101-9)
RASSI‚ D.M.; JUNTA‚ C.M.; FACHIN‚ A.N.A.L.; SANDRIN-GARCIA‚ P.; MELLO‚ S.; MARQUES‚ M.; FERNANDES‚ A.N.A.P.M.; FOSS-FREITAS‚ M.C.; FOSS‚ M.C.; SAKAMOTO-HOJO‚ E.T.; et al. Metabolism genes are among the differentially expressed ones observed in lymphomononuclear cells of recently diagnosed type 1 diabetes mellitus patients. Annals of the New York Academy of Sciences, v. 1079, n. 1, p. 171-176, 2006. (99/12135-9, 01/04101-9)
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DERNOWSEK, JANAINA A.; PEREIRA, MILENA C.; FORNARI, THAIS A.; MACEDO, CLAUDIA; ASSIS, AMANDA F.; DONATE, PAULA B.; BOMBONATO-PRADO, KARINA F.; PASSOS-BUENO, MARIA RITA; PASSOS, GERALDO A.. Posttranscriptional Interaction Between miR-450a-5p and miR-28-5p and STAT1 mRNA Triggers Osteoblastic Differentiation of Human Mesenchymal Stem Cells. Journal of Cellular Biochemistry, v. 118, n. 11, p. 4045-4062, NOV 2017. Citações Web of Science: 9. (07/57658-7)
PEZZI, NICOLE; ASSIS, AMANDA FREIRE; COTRIM-SOUSA, LARISSA COTRIM; LOPES, GABRIEL SARTI; MOSELLA, MARITZA SALAS; LIMA, DJALMA SOUSA; BOMBONATO-PRADO, KARINA F.; PASSOS, GERALDO ALEIXO. Aire knockdown in medullary thymic epithelial cells affects Aire protein, deregulates cell adhesion genes and decreases thymocyte interaction. Molecular Immunology, v. 77, p. 157-173, SEP 2016. Citações Web of Science: 5. (13/17481-1)
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MELLO, STEPHANO S.; FACHIN, ANA L.; JUNTA, CRISTINA M.; SANDRIN-GARCIA, PAULA; DONADI, EDUARDO A.; PASSOS, GERALDO A. S.; SAKAMOTO-HOJO, ELZA T.. Delayed Effects of Exposure to a Moderate Radiation Dose on Transcription Profiles in Human Primary Fibroblasts. Environmental and Molecular Mutagenesis, v. 52, n. 2, p. 117-129, MAR 2011. Citações Web of Science: 8. (99/12135-9, 02/07314-6)
BASSI, C. L.; MELLO, S. S.; CARDOSO, R. S.; GODOY, P. D. V.; FACHIN, A. L.; JUNTA, C. M.; SANDRIN-GARCIA, P.; CARLOTTI, C. G.; FALCAO, R. P.; DONADI, E. A.; et al. Transcriptional changes in U343 MG-a glioblastoma cell line exposed to ionizing radiation. HUMAN & EXPERIMENTAL TOXICOLOGY, v. 27, n. 12, p. 919-929, DEC 2008. Citações Web of Science: 14. (99/12135-9, 04/15611-6)
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SPECK-HERNANDEZ, CESAR A.; ASSIS, AMANDA F.; FELICIO, RAFAELA F.; COTRIM-SOUSA, LARISSA; PEZZI, NICOLE; LOPES, GABRIEL S.; BOMBONATO-PRADO, KARINA F.; GIULIATTI, SILVANA; PASSOS, GERALDO A.. Aire Disruption Influences the Medullary Thymic Epithelial Cell Transcriptome and Interaction With Thymocytes. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 9, MAY 7 2018. Citações Web of Science: 3. (13/17481-1)
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XAVIER, DANILO J.; TAKAHASHI, PAULA; EVANGELISTA, ADRIANE F.; FOSS-FREITAS, MARIA C.; FOSS, MILTON C.; DONADI, EDUARDO A.; PASSOS, GERALDO A.; SAKAMOTO-HOJO, ELZA T.. Assessment of DNA damage and mRNA/miRNA transcriptional expression profiles in hyperglycemic versus non-hyperglycemic patients with type 2 diabetes mellitus. MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS, v. 776, n. SI, p. 98-110, JUN 2015. Citações Web of Science: 11. (10/12069-7, 08/56594-8)
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TAKAHASHI, PAULA; XAVIER, DANILO J.; EVANGELISTA, ADRIANE F.; MANOEL-CAETANO, FERNANDA S.; MACEDO, CLAUDIA; COLLARES, CRISTHIANNA V. A.; FOSS-FREITAS, MARIA C.; FOSS, MILTON C.; RASSI, DIANE M.; DONADI, EDUARDO A.; et al. MicroRNA expression profiling and functional annotation analysis of their targets in patients with type 1 diabetes mellitus. Gene, v. 539, n. 2, p. 213-223, APR 15 2014. Citações Web of Science: 30. (10/12069-7, 10/00932-2, 10/05622-1, 08/56594-8)
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DONATE, PAULA B.; FORNARI, THAIS A.; MACEDO, CLAUDIA; CUNHA, THIAGO M.; NASCIMENTO, DANIELE C. B.; SAKAMOTO-HOJO, ELZA T.; DONADI, EDUARDO A.; CUNHA, FERNANDO Q.; PASSOS, GERALDO A.. T Cell Post-Transcriptional miRNA-mRNA Interaction Networks Identify Targets Associated with Susceptibility/Resistance to Collagen-induced Arthritis. PLoS One, v. 8, n. 1, JAN 24 2013. Citações Web of Science: 14. (08/56594-8)
OLIVEIRA, ERNNA H.; ASSIS, AMANDA F.; SPECK-HERNANDEZ, CESAR A.; DUARTE, MAX JORDAN; PASSOS, GERALDO A.. Aire Gene Influences the Length of the 3 ` UTR of mRNAs in Medullary Thymic Epithelial Cells. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 11, MAY 28 2020. Citações Web of Science: 0. (13/17481-1, 17/10780-4)
COTRIM-SOUSA, LARISSA; FREIRE-ASSIS, AMANDA; PEZZI, NICOLE; TANAKA, PEDRO PARANHOS; OLIVEIRA, ERNNA HERIDA; PASSOS, GERALDO ALEIXO. Adhesion between medullary thymic epithelial cells and thymocytes is regulated by miR-181b-5p and miR-30b. Molecular Immunology, v. 114, p. 600-611, OCT 2019. Citações Web of Science: 1. (13/17481-1, 17/10780-4)
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
OLIVEIRA, Ernna Hérida Domingues de. Vias de regulação da expressão gênica promíscua no timo envolve Aire e microRNAs. Tese (Doutorado) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto. (09/54694-8)
TAVARES, Thais Arouca Fornari. Análise da expressão gênica promíscua no timo de camundongos NOD (non obese diabetic) durante a emergência do Diabetes melitus tipo 1. Dissertação (Mestrado) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto. (05/57231-8)
CARDOSO, Renato Sousa. Avaliação dos efeitos da radiação gama na expressão de genes reguladores da recombinação V(D)J de receptores de células T. 172 f. Tese (Doutorado) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto. (00/09994-9)
ESPANHOL, Aline Renata. Cinética da expressão gênica diferencial durante a ontogenia do timo. 73 f. Dissertação (Mestrado) - Centro de Ciências Biológicas e da Saúde. Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos. (00/01705-8)
MAGALHÃES, Danielle Aparecida Rosa de. Análise do transcriptoma durante a ontogenia do timo.. Tese (Doutorado) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto. (03/00982-6)
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