Lucas Eduardo Costa Canesin

Atualmente, atuo como Bioinformata no Instituto Tecnológico Vale (ITV), a frente do projeto AmaZOOmics, hoje parte do Earth Biogenome Project (EBP). Neste projeto, buscamos sequenciar e montar genomas de referência de 30 espécies amazônicas ameaçadas de extinção. A Harpia é o primeiro genoma montado, em nível cromossômico e com menos de 1 erro de montagem por Mb montado, e anotado. Com esse genoma, estamos investigando o impacto da atividade de elementos transponíveis no extenso rearranjo cromossômico observado em Accipitridae. Anteriormente, atuei como Bioinformata no Genomics for Climate Change Research Center (GCCRC), onde montei os genomas de duas espécies endêmicas do Cerrado brasileiro (Campos Rupestres), que empregam estratégias muito distintas para lidar com a escassez hídrica sazonal. Cursei doutorado em Bioinformática e Genômica Evolutiva nos Laboratórios de Biologia de Sistemas, e de Genômica Evolutiva do Instituto de Biologia (Universidade Estadual de Campinas - Unicamp) e no Laboratório de Estudos da Expressão Gênica, do Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG), também na Unicamp. Nos dois primeiros, o projeto de pesquisa consistiu em investigar a evolução da informação no sistema genômico de populações de Arabidopsis thaliana, a partir do banco de dados 1001 Genomes, que disponibilizou 1135 genomas da espécie. No último, investiguei a resposta hierárquica de fatores de transcrição ao longo da variação sazonal hídrica das duas plantas tolerantes a dessecação, através da engenharia reversa de redes de regulação hierarquizadas. O projeto de mestrado, desenvolvido no Laboratório de Biologia de Sistemas (CBMEG/Unicamp), envolveu construção de redes biológicas relacionando lncRNAs e genes codantes de sorgo, espécie modelo para o metabolismo de açúcares em cana-de-açúcar. Possuo bacharelado e licenciatura em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Londrina (UEL) e realizei estágio de iniciação científica no Laboratório de Genética Molecular de Fungos, na UEL, e no Laboratório de Biotecnologia Vegetal do Instituto Agronômico do Paraná. No primeiro, identifiquei marcadores moleculares para a identificação de fungos filamentosos produtos de micotoxinas, através da técnica de RAPD; e no último, estabeleci protocolo de transformação genética via Agrobacterium tumefasciens no tomateiro, enquanto modelo de desenvolvimeto de frutos climatéricos, e analisei promotores tecido-específicos de interesse agronômico no cafeeiro . Possuo ainda experiência com cultivo e manipulação de linhagens de fungos produtores de ocratoxina, biologia molecular vegetal (técnicas como PCR, sequenciamento e transformação genética) e cultura de tecidos. (Fonte: Currículo Lattes)