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Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ) (Instituição-sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Brasil
Professor Associado em Microbiologia do Solo na Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo. Engenheiro agrônomo e Doutor em Genética e Melhoramento de Plantas pela mesma instituição. Livre Docente em Biologia do Solo pela ESALQ/USP. Representa a International Society for Microbial Ecology (ISME) no Brasil, e é Membro Afiliado a Academia Brasileira de Ciências. Atua na área de Microbiologia do Solo e Ambiental, com enfoque em análises independentes de cultivo de comunidades microbianas. Estuda comunidades microbianas em áreas naturais, como os biomas Mata Atlântica, Caatinga e Manguezais, e em áreas de produção agrícola. Tem como objetivo principal gerar conhecimento para o desenvolvimento de uma agricultura mais produtiva e sustentável, tendo a biologia do solo como base de inovação. (Fonte: Currículo Lattes)
O sistema de produção agrícola brasileiro é dependente do uso dos pesticidas agrícolas, moléculas utilizadas no controle de pragas e patógenos. No entanto, pouco é compreendido sobre a interação dessas substâncias com a fração viva dos solos. Neste contexto, o projeto tem por objetivo: i) inferir sobre as alterações na estruturação e na funcionalidade microbiana dos solos devido a apli...
Microrganismos coordenam os processos ecológicos dos quais a vida depende, sendo que nós sabemos menos sobre sua biodiversidade, do que para plantas e animais. A Ecologia Microbiana é muita sofisticada na estimativa das dimensões filogenética, genética e funcional da biodiversidade microbiana, porém, a integração dessas dimensões é alusiva. Este projeto irá combinar recentes avanços se...
Resíduos biológicos agrícolas e outras fontes podem ser vistos tanto como um empecilho na cadeia produtiva ou como uma grande oportunidade para aplicações biotecnológicas. Neste contexto, o projeto MICROWASTE pretende estudar consórcios microbianos envolvidos na degradação do material lignocelulósico presente nos resíduos biológicos agrícolas (restos da cultura de cana-de-açúcar [BRA] ...
Dentre os ecossistemas terrestres, alguns chamam atenção devido à particular combinação de condições ambientais únicas, que resultam na evolução de espécies capazes de colonizar restritamente estes ambientes. Os manguezais compõem um bioma composto por espécies de plantas, animais e microrganismos que interagem neste ambiente que tem como principal característica a interface entre o co...
Orquídeas possuem sementes diminutas que não possuem reservas para germinação. Na natureza, a germinação das sementes ocorre em simbiose mutualística com fungos micorrízicos, os quais transferem açúcares simples para os tecidos vegetais. Todas as orquídeas são mico-heterotróficas nos início de seu desenvolvimento, passando por um estágio mixotrófico, onde o suprimento de açúcares é de ...
Os microrganismos presentes nos solos são de extrema importância para o bom desenvolvimento de plantas. Entre eles, podemos citar bactérias do gênero Bacillus e fungos do gênero Trichoderma, os quais estão diretamente ligados a ciclagem de nutrientes, a promoção do crescimento vegetal por meio da produção de fitormônios e ao controle biológico por meio da supressão e do antagonismo a p...
Nematoides são pequenos animais pertencentes ao filo Nematoda, que apresentam elevada diversidade no solo e realizam funções ambientais importantes. Tradicionalmente, a avaliação de nematoides tem sido realizada por meio de métodos de microscopia que dependem de alto nível de conhecimento em taxonomia, além de demandarem demasiado tempo. Visando superar essas limitações, abordagens mol...
A cobertura permanente do solo é uma das três propriedades da agricultura conservacionista para melhorar a qualidade do solo e a sustentabilidade da produção agrícola. Para proteger os solos, a cobertura superficial pode ser realizada por resíduos de culturas ou culturas de cobertura, promovendo o aumento da matéria orgânica do solo, interferindo nas as características físicas e químic...
A cana-de-açúcar é atualmente a cultura de maior importância agrícola do estado de São Paulo e tem papel de destaque entre as principais culturas do Brasil. Dentro do manejo desta cultura, a manutenção da palha sobre a superfície do solo resulta em melhoria dos atributos físicos e químicos, contribuindo para o aumento do estoque de carbono, da atividade biológica e do armazenamento de ...
As florestas da Bacia Amazônica constituem as maiores florestas tropicais do mundo e abrigam uma grande biodiversidade endêmica. No entanto, o crescimento populacional na região tem impulsionado nas últimas décadas, a conversão destas florestas em áreas de pastagens e lavouras. Essa mudança de uso do solo ocasiona perda da biodiversidade e desregula processos relacionados a estoque de ...
Em solos tropicais altamente intemperizados, o fósforo (P) encontra-se pouco disponível, o que torna as associações simbióticas com fungos micorrízicos arbusculares (FMA) uma estratégia de aquisição deste nutriente pelas plantas. Sabe-se que a comunidade microbiana interage fortemente com os FMA, afetando a colonização micorrízica das plantas hospedeiras. Entretanto pouco se conhece so...
Em solos tropicais altamente intemperizados, o fósforo (P) não é amplamente disponível, e o fornecimento de P via fertilizante é necessária para satisfazer a demanda da planta. Em contraste, em solos temperados, a adsorção de P é reduzida e este está mais disponível para as plantas. Em geral, a comunidade microbiana do solo pode interagir de várias maneiras (tanto negativa quanto posit...
Os manguezais são áreas localizadas nas planícies de inundação das marés, compondo um dos ambientes naturais mais degradados no Brasil. O uso de metodologias que acessam a estrutura e o funcionamento dos grupos microbianos nos manguezais, bem como a descrição dos plasmídeos que hospedam genes relacionados a importantes transformações neste sistema, é importante no avanço do conheciment...
Brasil é o maior produtor mundial de cana e de seus principais derivados de etanol e açúcar. Campos de cultivo estão em constante expansão, ocupando áreas com variações distintas de temperatura, regime de chuvas, sistemas de cultivo, manejos de palha e rotação de culturas, possivelmente moldar a comunidade microbiana em solos. Com o objetivo de entender melhor tal efeito, a biogeografi...
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
| Publicações | 34 |
| Citações | 292 |
| Cit./Artigo | 8,6 |
| Dados do Web of Science | |
COTTA, SIMONE RAPOSO; CADETE, LUANA LIRA; VAN ELSAS, JAN DIRK; ANDREOTE, FERNANDO DINI; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE. Exploring bacterial functionality in mangrove sediments and its capability to overcome anthropogenic activity. Marine Pollution Bulletin, v. 141, p. 586-594, APR 2019. Citações Web of Science: 0. (12/14534-4, 12/06245-2)
OTTONI, JULIA RONZELLA; CABRAL, LUCELIA; PEREIRA DE SOUSA, SANDERSON TARCISO; LACERDA JUNIOR, GILENO VIEIRA; DOMINGOS, DANIELA FERREIRA; SOARES JUNIOR, FABIO LINO; PINHEIRO DA SILVA, MYLENNE CALCIOLARI; MARCON, JOELMA; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; DE MELO, ITAMAR SOARES; et al. Functional metagenomics of oil-impacted mangrove sediments reveals high abundance of hydrolases of biotechnological interest. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, v. 33, n. 7, JUL 2017. Citações Web of Science: 6. (12/14534-4, 13/09386-9, 12/16850-0, 10/15519-3, 10/51981-3, 11/50809-5, 13/22555-4)
MORAIS, DANIEL K.; ROESCH, LUIZ F. W.; REDMILE-GORDON, MARC; SANTOS, FAUSTO G.; BALDRIAN, PETR; ANDREOTE, FERNANDO D.; PYLRO, VICTOR S.. BTW-Bioinformatics Through Windows: an easy-to-install package to analyze marker gene data. PeerJ, v. 6, JUL 30 2018. Citações Web of Science: 1. (14/50320-4, 16/02219-8)
RIGONATO, JANAINA; KENT, ANGELA D.; GUMIERE, THIAGO; ZANINI BRANCO, LUIZ HENRIQUE; ANDREOTE, FERNANDO DINI; FIORE, MARLI FATIMA. Temporal assessment of microbial communities in soils of two contrasting mangroves. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, n. 1, p. 87-96, JAN-MAR 2018. Citações Web of Science: 4. (04/13910-6, 13/18529-8, 07/08354-5)
LOPES, LUCAS DANTAS; DAVIS, II, EDWARD W.; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE C.; WEISBERG, ALEXANDRA J.; BRESCIANI, LUANA; CHANG, JEFF H.; LOPER, JOYCE E.; ANDREOTE, FERNANDO D.. Tropical soils are a reservoir for fluorescent Pseudomonas spp. biodiversity. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, v. 20, n. 1, p. 62-74, JAN 2018. Citações Web of Science: 3. (13/50353-7)
LOPES, LUCAS DANTAS; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE C.; WEISBERG, ALEXANDRA J.; DAVIS, EDWARD W.; YAN, QING; VARIZE, CAMILA DE S.; WU, CHIH-FENG; CHANG, JEFF H.; LOPER, JOYCE E.; ANDREOTE, FERNANDO D.. Genome variations between rhizosphere and bulk soil ecotypes of a Pseudomonas koreensis population. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, v. 20, n. 12, SI, p. 4401-4414, DEC 2018. Citações Web of Science: 0. (13/50353-7)
PYLRO, VICTOR SATLER; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; ANDREOTE, FERNANDO DINI; MORAIS, DANIEL KUMAZAWA; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO; FASANELLA ANDREOTE, CRISTIANE CIPOLLA; DE ALMEIDA BERNARDO, EDUARDO ROBERTO; ZUCCHI, TIAGO. Closed Genome Sequence of Phytopathogen Biocontrol Agent Bacillus velezensis Strain AGVL-005, Isolated from Soybean. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 6, n. 7, FEB 2018. Citações Web of Science: 0. (14/50320-4, 16/02219-8)
DA COSTA, DIOGO P.; DIAS, ARMANDO C. F.; COTTA, SIMONE R.; VILELA, DANIELLA; DE ANDRADE, PEDRO A. M.; PELLIZARI, VIVIAN H.; ANDREOTE, FERNANDO DINI. Changes of bacterial communities in the rhizosphere of sugarcane under elevated concentration of atmospheric CO2. Global Change Biology Bioenergy, v. 10, n. 2, p. 137-145, FEB 2018. Citações Web of Science: 5. (11/04857-8, 12/14534-4, 11/07343-5, 13/50353-7)
LUVIZOTT, DANICE M.; ARAUJO, JULIANA E.; SILVA, MICHELE DE CASSIA P.; DIAS, ARMANDO C. F.; KRAFT, BEATE; TEGETMEYE, HALINA; STROUS, MARC; ANDREOTE, FERNANDO D.. The rates and players of denitrification, dissimilatory nitrate reduction to ammonia (DNRA) and anaerobic ammonia oxidation (anammox) in mangrove soils. Anais da Academia Brasileira de Ciências, v. 91, n. 1, 2019. Citações Web of Science: 0. (04/13910-6, 15/01290-8, 12/06245-2)
RODRIGUES, EDMO MONTES; MORAIS, DANIEL KUMAZAWA; PYLRO, VICTOR SATLER; REDMILE-GORDON, MARC; DE OLIVEIRA, JURACI ALVES; WURDIG ROESCH, LUIZ FERNANDO; CESAR, DIONEIA EVANGELISTA; TOTOLA, MARCOS ROGERIO. Aliphatic Hydrocarbon Enhances Phenanthrene Degradation by Autochthonous Prokaryotic Communities from a Pristine Seawater. MICROBIAL ECOLOGY, v. 75, n. 3, p. 688-700, APR 2018. Citações Web of Science: 3. (16/02219-8)
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COTTA, SIMONE RAPOSO; CADETE, LUANA LIRA; VAN ELSAS, JAN DIRK; ANDREOTE, FERNANDO DINI; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE. Exploring bacterial functionality in mangrove sediments and its capability to overcome anthropogenic activity. Marine Pollution Bulletin, v. 141, p. 586-594, APR 2019. Citações Web of Science: 0. (12/14534-4, 12/06245-2)
OTTONI, JULIA RONZELLA; CABRAL, LUCELIA; PEREIRA DE SOUSA, SANDERSON TARCISO; LACERDA JUNIOR, GILENO VIEIRA; DOMINGOS, DANIELA FERREIRA; SOARES JUNIOR, FABIO LINO; PINHEIRO DA SILVA, MYLENNE CALCIOLARI; MARCON, JOELMA; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; DE MELO, ITAMAR SOARES; et al. Functional metagenomics of oil-impacted mangrove sediments reveals high abundance of hydrolases of biotechnological interest. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, v. 33, n. 7, JUL 2017. Citações Web of Science: 6. (12/14534-4, 13/09386-9, 12/16850-0, 10/15519-3, 10/51981-3, 11/50809-5, 13/22555-4)
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RIGONATO, JANAINA; KENT, ANGELA D.; GUMIERE, THIAGO; ZANINI BRANCO, LUIZ HENRIQUE; ANDREOTE, FERNANDO DINI; FIORE, MARLI FATIMA. Temporal assessment of microbial communities in soils of two contrasting mangroves. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, n. 1, p. 87-96, JAN-MAR 2018. Citações Web of Science: 4. (04/13910-6, 13/18529-8, 07/08354-5)
LOPES, LUCAS DANTAS; DAVIS, II, EDWARD W.; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE C.; WEISBERG, ALEXANDRA J.; BRESCIANI, LUANA; CHANG, JEFF H.; LOPER, JOYCE E.; ANDREOTE, FERNANDO D.. Tropical soils are a reservoir for fluorescent Pseudomonas spp. biodiversity. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, v. 20, n. 1, p. 62-74, JAN 2018. Citações Web of Science: 3. (13/50353-7)
CABRAL, LUCELIA; NORONHA, MELLINE FONTES; PEREIRA DE SOUSA, SANDERSON TARCISO; LACERDA-JUNIOR, GILENO VIEIRA; RICHTER, LARISSA; FOSTIER, ANNE HELENE; ANDREOTE, FERNANDO DINI; HESS, MATTHIAS; DE OLIVEIRA, VALERIA MAIA. The metagenomic landscape of xenobiotics biodegradation in mangrove sediments. ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY, v. 179, p. 232-240, SEP 15 2019. Citações Web of Science: 0. (13/20670-0, 12/16850-0, 12/06245-2, 11/50809-5)
GUMIERE, THIAGO; ROUSSEAU, ALAIN N.; DA COSTA, DIOGO PAES; CASSETARI, ALICE; COTTA, SIMONE RAPOSO; ANDREOTE, FERNANDO DINI; GUMIERE, SILVIO J.; PAVINATO, PAULO SERGIO. Phosphorus source driving the soil microbial interactions and improving sugarcane development. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, MAR 13 2019. Citações Web of Science: 0. (13/18529-8)
FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; COTTA, SIMONE RAPOSO; ANDREOTE, FERNANDO DINI; VAN ELSAS, JAN DIRK. The parA Region of Broad-Host-Range PromA Plasmids Is a Carrier of Mobile Genes. MICROBIAL ECOLOGY, v. 75, n. 2, p. 479-486, FEB 2018. Citações Web of Science: 3. (15/01290-8)
DURRER, ADEMIR; GUMIERE, THIAGO; TAKETANI, RODRIGO GOUVEA; DA COSTA, DIOGO PAES; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CASSIA; ANDREOTE, FERNANDO DINI. The drivers underlying biogeographical patterns of bacterial communities in soils under sugarcane cultivation. APPLIED SOIL ECOLOGY, v. 110, p. 12-20, FEB 2017. Citações Web of Science: 12. (11/04319-6, 11/07343-5)
HALSEY, JOSHUA ANDREW; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CASSIA; ANDREOTE, FERNANDO DINI. Bacterial selection by mycospheres of Atlantic Rainforest mushrooms. ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY, v. 109, n. 10, p. 1353-1365, OCT 2016. Citações Web of Science: 6. (10/16635-7)
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
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VALADARES, Rafael Borges da Silva. Identificação de genes e proteínas envolvidos na regulação de micorrizas de orquídeas. Tese (Doutorado) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz. Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba. (11/01727-6)
GUMIERE, Thiago. Dinâmica espaço-temporal da comunidade microbiana de solos cultivados com cana-de-açúcar. Tese (Doutorado) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz. Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba. (13/18529-8)
COSTA, Diogo Paes da. Descrição da comunidade microbiana associada à rizosfera de cana-de-açúcar. Dissertação (Mestrado) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz. Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba. (11/04857-8)
GUMIERE, Thiago. Biogeografia de comunidades fúngicas em áreas cultivadas com cana-de-açúcar. Dissertação (Mestrado) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz. Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba. (11/04319-6)
BIGATON, Ademir Durrer. Diversidade de bactérias e arquéias em solos cultivados com cana-de-açúcar: um enfoque biogeográfico. Tese (Doutorado) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz. Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba. (11/07343-5)
FERREIRA, Dorotéia Alves. Interações entre fungos micorrízicos arbusculares e a microbiota de solos. Tese (Doutorado) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz. Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba. (13/04388-3)
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