Caracterização por DGGE da comunidade bacteriana endofítica e análise da interação com Xylella fastidiosa pelo método de PCR em tempo real

Resumo

O grupo de pesquisa do Laboratório de Genética de Microrganismos da ESALQ/USP no projeto temático intitulado "O papel de genes associados à goma xantana na virulência e patogenicidade de Xylella fastidiosa e o desenvolvimento de estratégias para o controle biológico da CVC" dentro do "Programa genoma funcional de X. fastidiosa" está tentando desenvolver uma estratégia de controle biológico da CVC, utilizando bactérias endofíticas isoladas de citros. Como seqüência deste trabalho serão realizadas inúmeras análises de interação entre a comunidade endofítica de citros e X. fastidiosa, visando avaliar as interações que ocorrem entre as diferentes populações microbianas. Dentro deste contexto, este projeto tem como principal objetivo avaliar a comunidade microbiana de citros, em especial populações de Methylobacterium spp., e a sua interação com X. fastidiosa, agente causal da CVC, por meio da técnica de PCR quantitativo (Real Time PCR) e DGGE. Os objetivos específicos do projeto serão: a) quantificar por PCR em tempo real a bactéria endofítica Methylobacterium mesophilicum em plântulas de citros; b) quantificar por PCR em tempo real X. fastidiosa em plantas resistentes e afetadas pela CVC; c) avaliar por meio de PCR em tempo real a interação entre X. fastidiosa e Methylobacterium spp. em plântulas de citros; d) avaliar a comunidade bacteriana endofítica por meio do DGGE; e) avaliar a interação entre M. mesophilicum e/ou X. fastidiosa com a comunidade bacteriana endofítica de citros. (AU)