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Desenvolvimento, validação e aplicação de método molecular baseado na extração, amplificação e sequenciamento do rRNA ribossômico para a identificação das bactérias formadoras de biofilme na superfície..

Processo: 06/58561-4
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2007
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2009
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:René Peter Schneider
Beneficiário:Roberta Novaes Amorim Almeida
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Técnicas de tipagem bacteriana   Filtração   Osmose reversa   Biofilmes   Extração de RNA
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Bacteria | Biofilme | Identificacao | Metodos Moleculares | Osmose Reversa | Rrna 165

Resumo

Um importante fator de redução da eficiência de filtração de água em sistemas de osmose reversa e a formação de camadas de "biofouling" na superfície das membranas per microrganismos. A identidade dos organismos formadores de biofouling e desconhecida. O objetivo deste projeto e o desenvolvimento de um protocolo de análise para a identificação destes organismos. Este protocolo será baseado na extração do RNA ribossômico 16S de amostras de biofilmes para posterior amplificação e clonagem. Os clones obtidos serão analisados por método de screening (OOGE). Amplicons representativos de organismos diferentes serão seqüenciados. Esta informação será empregada para a confecção de sondas para análise de biofilmes por hibridação com sondas fluorescentes (FISH) em microscopia. Esta técnica permitirá caracterizar a distribuição dos organismos identificados nos biofilmes. Os organismos formadores de biofilme serão os organismos formadores de microcolônias no interior do biofilme. Este conjunto de métodos será empregado para verificar se os biofilmes localizados em folhas de membranas diferentes de um mesmo módulo ou em posições diferentes de uma mesma folha de membrana deste módulo foram produzidos pelo mesmo conjunto de microrganismos. Esta informação será fundamental para estabelecer uma estratégia de estudo da biodiversidade de bactérias formadoras de biofilmes em membranas de osmose reversa de diferentes sistemas e de diferentes artes do Brasil em etapa posterior a este mestrado. (AU)

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Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
ALMEIDA, Roberta Novaes Amorim. Desenvolvimento, validação e aplicação de método molecular baseado na análise do rRNA para a identificação das bactérias formadoras de biofilme metabolicamente ativas na superfície das membranas de osmose reversa.. 2009. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) São Paulo.