Biologia de sistemas aplicada à agricultura: análise de transcriptomas e interactomas

Resumo

Ligado ao projeto de Jovem Pesquisador Biologia de sistemas aplicada à agricultura: análise de transcriptomas e interactomas, sob a responsabilidade do Dr. Marcelo Mendes Brandão.O candidato a bolsa de treinamento técnico nível 4 ou 5 deverá mostrar capacidade de auxiliar na montagem e configuração um sistema de cluster de computadores do tipo Beowulf. Este, também ficará responsável pela manutenção tanto do software como do hardware do sistema implantado no laboratório.OBJETIVOS*Auxiliar na montagem e configuração dos sistemas computacionais propostos no projeto.*Auxiliar na execução das análises matemáticas e computacionais contidas nos projetos do laboratório e em colaboração, prestando auxílio computacional na área de programação e bioinformática.*Programação do sistema de atualização do AtPINDB.*Adequação dos processos de análises computacionais a serem realizadas no clsuter computacionalPLANO DE TRABALHONuma primeira fase, o recipiente da bolsa irá ajudar o pesquisador principal do projeto proposto a montar fisicamente e testar todos os componentes necessários para a implantação de um sistema de computação em cluster, incluindo hardware de cálculo e servidores centrais, sistema de estocagem de dados e cabeamento de alto desempenho. Após esta fase inicial, o bolsista operará na manutenção da disponibilidade do sistema computacional, efetuando todas as manutenções e atualizações necessárias para que o cluster instalado não tenha períodos de falta de serviço geral ou de algum aplicativo específico. Este profissional auxiliará os usuários do grupo de Bioinformática na adequação e configuração de suas análises a fim de utilizar o sistema de cluster ou estações de trabalho.JUSTIFICATIVAA manutenção de um laboratório de Bioinformática requer mão de obra especializada na área de computação científica. A presença deste profissional na execução do referido projeto será de enorme valia, uma vez que tira dos pesquisadores a obrigatoriedade de parar suas atividades de pesquisa e desenvolvimento para solução de problemas e inadequações do sistema computacional.