Evolução molecular de regiões regulatórias de genes HOX associados com a morfologia da nadadeira de peixes, com especial ênfase em Chondrichthyes

Resumo

A evolução das regiões de regulação gênica, em especial nos genes expressos durante o desenvolvimento embrionário, parece estar diretamente relacionada com processos evolutivos que resultam na origem de novas morfologias, dado que variações em regiões regulatórias determinam mudanças nos padrões de expressão de genes durante a formação de estruturas específicas. A presente proposta de pesquisa objetiva investigar associações entre a sequência de nucleotídeos da região regulatória CsB, que controla a expressão dos genes mais próximos da extremidade 5' do cluster do HoxD (i.e. Hoxd11 e Hoxd13) durante a formação do broto dos apêndices pareados nos vertebrados. As sequências serão analisadas quanto à presença tanto de regiões conservadas quanto de regiões com altas taxas de substituição de nucleotídeos, para posterior inferência sobre presença de sítios de ligação para fatores de transcrição específicos. Serão analisadas espécies de condrictes que representem a maior parte da variação morfológica das nadadeiras dos principais clados (i.e. Squalomorphi e Galeomorphi) e comparados com representantes dos grandes grupos de Actinopterygii. Os fragmentos da referida região regulatória serão obtidos a partir de reações de PCR com posterior clonagem e sequenciamento. Para tanto, serão utilizados primers degenerados desenvolvidos no laboratório colaborador deste projeto (FFCLRP-USP) os quais foram previamente testados, com sucesso, em estudo preliminar à presente proposta. O grupo escolhido visa mostrar como (e se) a variação morfológica das nadadeiras dos peixes é resultante da evolução molecular desta região regulatória. Este estudo também contribuirá para o entendimento da evolução genotípica em espécies não-modelos nos estudos de biologia evolutiva do desenvolvimento.