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Amplificação heteróloga e otimização de loci de microssatélites nucleares em espécies de Bromeliaceae

Processo: 13/16440-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2013
Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2014
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Clarisse Palma da Silva
Beneficiário:Carla Haisler Sardelli
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:09/52725-3 - Especiação, isolamento reprodutivo e genética de populações na família Bromeliaceae: implicações taxonômicas, evolutivas e conservacionistas, AP.BTA.JP
Assunto(s):Genética populacional   Bromelia   Ecologia molecular   Filogeografia
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:bromélias | Ecologia molecular | Filogeografia | Genética de populações | microssatelites nucleares | Ecologia Molecular

Resumo

Atualmente existem diferentes técnicas de biologia molecular que permitem a detecção da variabilidade existente ao nível do DNA. Os marcadores de microssatélites possuem características desejáveis para serem utilizados em estudos de genética de populações e são atualmente os mais populares neste tipo de estudo. Estes marcadores moleculares podem ser utilizados para resolver questões de diferentes ordens: à paternidade, à estrutura genética de populações e à comparações entre espécies proximamente relacionadas. Apesar das análises de regiões de microssatélites terem se tornado uma ferramenta muito útil para uma grande variedade de estudos de variabilidade genética em populações, sua caracterização em novas espécies é ainda um processo caro e trabalhoso. No entanto, recentes evidências sugerem que muitos marcadores de microssatélites podem funcionar em espécies proximamente relacionadas. Somente há pouco tempo, marcadores do tipo microssatélites começaram a ser utilizados para estudos de genética de populações em Bromeliaceae. Atualmente cerca de 35 loci de microssatélites nucleares foram isolados e caracterizados em espécies de Bromélias; Tillandsia e Guzmania; Vriesea e Alcantarea.Os trabalhos realizados com espécies de bromélias mostram que existe um grande sucesso na amplificação heteróloga de loci de microssatélites nucleares mesmo entre espécies pertencentes a diferentes subfamílias. As atividades que serão realizadas pela bolsista será: auxiliar nas coletas de campo e extração de DNA das amostras dos três sub-projetos; otimizar os protocolos de extração de DNA para diferentes espécies de bromélias; otimizar os protocolos de amplificação para loci de microssatélites nucleares desenvolvidos para outras espécies de bromélias; Preparar os tampões necessários para todas as etapas dos procedimentos de extração DNA e eletroforese em gel de agarose; Auxiliar na aquisição e implementação de matérias e permanentes de consumo.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MOTA, MATEUS RIBEIRO; PINHEIRO, FABIO; DOS SANTOS LEAL, BARBARA SIMOES; SARDELLI, CARLA HAISLER; WENDT, TANIA; PALMA-SILVA, CLARISSE. From micro- to macroevolution: insights from a Neotropical bromeliad with high population genetic structure adapted to rock outcrops. HEREDITY, . (14/15588-6, 13/16440-0, 14/02377-7, 09/52725-3, 18/07596-0, 15/07685-4, 13/12966-7)
MOTA, MATEUS RIBEIRO; PINHEIRO, FABIO; DOS SANTOS LEAL, BARBARA SIMOES; SARDELLI, CARLA HAISLER; WENDT, TANIA; PALMA-SILVA, CLARISSE. From micro- to macroevolution: insights from a Neotropical bromeliad with high population genetic structure adapted to rock outcrops. HEREDITY, v. 125, n. 5, p. 353-370, . (14/02377-7, 14/15588-6, 13/12966-7, 13/16440-0, 18/07596-0, 15/07685-4, 09/52725-3)