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Organização espacial de tecidos e análise fractal para a taxonomia automatizada de plantas

Processo: 13/22205-3
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de abril de 2014
Data de Término da vigência: 31 de março de 2015
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
Pesquisador responsável:Odemir Martinez Bruno
Beneficiário:Joao Batista Florindo
Supervisor: Gabriel Landini
Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: University of Birmingham, Inglaterra  
Vinculado à bolsa:12/19143-3 - Geometria Fractal e Análise de Imagens Aplicadas à Biologia Vegetal, BP.PD
Assunto(s):Visão computacional   Análise de imagens   Dimensão fractal   Morfometria
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Análise de imagens | Geometria Fractal | Morfometria Vegetal | Visão Computacional

Resumo

Este trabalho propõe a investigação da identificação de espécies de plantas por métodos de análise de imagens baseados em fractais. As imagens foliares serão obtidas por três modalidades diferentes (superfície escaneada da folha, imagens microscópicas de estômatos e cortes histológicos) e serão analisadas usando-se métodos computacionais inovadores desenvolvidos inicialmente para a análise da arquitetura de tumores e geometria de células cancerosas como proposto pelo supervisor na Universidade de Birmingham. Tais métodos incluem dimensões fractais assintóticas, caracterização morfológica de vizinhanças celulares e dimensão fractal local conectada. Outras abordagens estudadas pelo pesquisador de pós-doutorado em sua instituição de origem serão aplicadas, incluindo os descritores fractais e a dimensão fractal multiescala. A razão deste estudo é que a análise de imagens pode fornecer uma nova perspectiva sobre a identificação taxonômica, integrando a análise do arranjo de micro e macro-texturas na folha, os quais expressam tanto o processo evolucionário quanto as inter-relações entre as estruturas biológicas e o ambiente. Deste modo, a análise proposta pode fornecer uma descrição útil e imparcial de amostras de tecidos de plantas para facilitar uma categorização de espécies mais precisa e confiável. Este trabalho vai contribuir tanto para a comunidade de análise de imagens quanto para pesquisadores em botânica e em cancerologia já que desenvolve metodologias computacionais pouco dispendiosas para extrair dados quantitativos para propósitos de classificação. (AU)

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Publicações científicas (11)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
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FLORINDO, JOAO BATISTA; BRUNO, ODEMIR MARTINEZ. Fractal Descriptors of Texture Images Based on the Triangular Prism Dimension. Journal of Mathematical Imaging and Vision, v. 61, n. 1, p. 140-159, . (13/22205-3, 16/16060-0, 12/19143-3, 14/08026-1)
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FLORINDO, JOAO BATISTA; BRUNO, ODEMIR MARTINEZ; ROSSATTO, DAVI RODRIGO; KOLB, ROSANA MARTA; CECILIA GOMEZ, MARIA; LANDINI, GABRIEL. Identifying plant species using architectural features in leaf microscopy images. BOTANY, v. 94, n. 1, p. 15-21, . (11/01523-1, 13/22205-3, 11/23112-3)
FLORINDO, JOAO BATISTA; ASSIRATI, LUCAS; BRUNO, ODEMIR MARTINEZ. Locally enhancing fractal descriptors by using the non-additive entropy. PATTERN RECOGNITION LETTERS, v. 70, p. 32-37, . (11/01523-1, 12/19143-3, 13/22205-3)