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Estudos de sistemas multiméricos de proteínas através de cross-linking, espectrometria de massas e modelagem molecular

Processo: 15/13667-9
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de março de 2016
Data de Término da vigência: 14 de fevereiro de 2018
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
Pesquisador responsável:Leandro Martinez
Beneficiário:Ricardo Nascimento dos Santos
Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/08293-7 - CECC - Centro de Engenharia e Ciências Computacionais, AP.CEPID
Assunto(s):Espectrometria de massas   Simulação de dinâmica molecular   Proteínas   Modelagem molecular   Modelagem computacional
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:cross-linking | Dinâmica Molecular | Espectrometria de massas | Modelagem computacional | Proteinas | Modelagem Molecular

Resumo

O presente projeto de pós doutorado propõe o desenvolvimento de uma nova metodologia para determinar a estrutura quaternária de complexos proteicos através da combinação de métodos experimentais como cross-linking. Espectrometria de Massas e simulações computacionais aplicando modelos baseados em estrutura (SBMs). Esta estratégia pode se tornar uma metodologia eficiente e generalizada para estudar o funcionamento de diversos mecanismos celulares ainda desconhecidos.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DOS SANTOS, RICARDO N.; BOTTINO, GUILHERME F.; GOZZO, FABIO C.; MORCOS, FARUCK; MARTINEZ, LEANDRO. Structural complementarity of distance constraints obtained from chemical cross-linking and amino acid coevolution. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 88, n. 4, . (18/14274-9, 10/16947-9, 15/13667-9, 18/24293-0, 13/08293-7, 14/17264-3)
DOS SANTOS, RICARDO N.; FERRARI, ALLAN J. R.; DE JESUS, HUGO C. R.; GOZZO, FABIO C.; MORCOS, FARUCK; MARTINEZ, LEANDRO. Enhancing protein fold determination by exploring the complementary information of chemical cross-linking and coevolutionary signals. Bioinformatics, v. 34, n. 13, p. 2201-2208, . (13/08293-7, 13/05475-7, 16/13195-2, 14/17264-3, 15/13667-9, 10/16947-9)
DOS SANTOS, RICARDO NASCIMENTO; KHAN, SHAHID; MORCOS, FARUCK. Characterization of C-ring component assembly in flagellar motors from amino acid coevolution. ROYAL SOCIETY OPEN SCIENCE, v. 5, n. 5, . (15/13667-9)