Bolsa 15/13667-9 - Espectrometria de massas, Simulação de dinâmica molecular

Processo:	15/13667-9
Modalidade de apoio:	Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência:	01 de março de 2016
Data de Término da vigência:	14 de fevereiro de 2018
Área de conhecimento:	Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas

Pesquisador responsável:	Leandro Martinez
Beneficiário:	Ricardo Nascimento dos Santos

Instituição Sede:	Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil

Vinculado ao auxílio:	13/08293-7 - CECC - Centro de Engenharia e Ciências Computacionais, AP.CEPID


Assunto(s):	Espectrometria de massas Simulação de dinâmica molecular Proteínas Modelagem molecular Modelagem computacional
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:	cross-linking \| Dinâmica Molecular \| Espectrometria de massas \| Modelagem computacional \| Proteinas \| Modelagem Molecular
Resumo O presente projeto de pós doutorado propõe o desenvolvimento de uma nova metodologia para determinar a estrutura quaternária de complexos proteicos através da combinação de métodos experimentais como cross-linking. Espectrometria de Massas e simulações computacionais aplicando modelos baseados em estrutura (SBMs). Esta estratégia pode se tornar uma metodologia eficiente e generalizada para estudar o funcionamento de diversos mecanismos celulares ainda desconhecidos.

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Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DOS SANTOS, RICARDO N.; BOTTINO, GUILHERME F.; GOZZO, FABIO C.; MORCOS, FARUCK; MARTINEZ, LEANDRO. Structural complementarity of distance constraints obtained from chemical cross-linking and amino acid coevolution. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 88, n. 4, NOV 2019. (18/14274-9, 10/16947-9, 15/13667-9, 18/24293-0, 13/08293-7, 14/17264-3)

DOS SANTOS, RICARDO N.; FERRARI, ALLAN J. R.; DE JESUS, HUGO C. R.; GOZZO, FABIO C.; MORCOS, FARUCK; MARTINEZ, LEANDRO. Enhancing protein fold determination by exploring the complementary information of chemical cross-linking and coevolutionary signals. Bioinformatics, v. 34, n. 13, p. 2201-2208, JUL 1 2018. (13/08293-7, 13/05475-7, 16/13195-2, 14/17264-3, 15/13667-9, 10/16947-9)

DOS SANTOS, RICARDO NASCIMENTO; KHAN, SHAHID; MORCOS, FARUCK. Characterization of C-ring component assembly in flagellar motors from amino acid coevolution. ROYAL SOCIETY OPEN SCIENCE, v. 5, n. 5, MAY 2018. (15/13667-9)

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