| Processo: | 17/02302-5 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 08 de março de 2017 |
| Data de Término da vigência: | 30 de abril de 2017 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal |
| Pesquisador responsável: | Lúcia Garcez Lohmann |
| Beneficiário: | Alison Gonçalves Nazareno |
| Supervisor: | Christopher William Dick |
| Instituição Sede: | Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | University of Michigan, Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 13/12633-8 - Filogeografia comparada de plantas na Amazônia Central, BP.PD |
| Assunto(s): | Sequenciamento de nova geração Amazônia Rios Genética de populações vegetais |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Amazonia | ddRAD-Seq | marcadores SNPs | sequenciamento de nova geração | Genômica de populações |
Resumo A Amazônia representa um dos Biomas mais diversos no Planeta. Apesar disso, pouco ainda se sabe sobre os processos ecológicos e evolutivos que levaram às altas taxas de diversificação, manutenção e distribuição das espécies nesta região. Neste estudo, iremos amostrar quatro espécies de plantas com diferentes modos de dispersão (i.e., Amphirrhox longifolia, Buchenavia oxypetala, Passiflora spinosa e Psychotria sp.), com o objetivo de testar a Hipótese de Rios de Wallace.Embora existam muitos estudos sobre o impacto dos rios como barreiras genéticas para espécies animais, há poucos estudos que examinam cuidadosamente o impacto dos rios da Bacia Amazônica na divergência genética de espécies vegetais. Para testar a Hipótese de Wallace, 14 populações de cada espécie coletadas nas margens dos Rios Negro ou Branco serão analisadas. Utilizando o sequenciamento de nova geração, será empregada a técnica de sequenciamento massivo de sequências associadas a sítios de restrição (ddRAD-seq, double digest Restriction site Associated DNA sequencing) para identificar marcadores SNPs (Single Nucleotide Polimorphism) no genoma de 467 indivíduos amostrados. Essa metodologia é recente dentro da genética de populações, permitindo analisar um grande número de marcadores genéticos (genômica de populações). Os resultados obtidos neste estudo irão permitir determinar o padrão de diferenciação genética dentro e entre as margens dos rios, bem como verificar se estes padrões são decorrentes do isolamento geográfico. Este projeto é uma colaboração entre o Laboratório de Sistemática Vegetal (Departamento de Botânica) da Universidade de São Paulo (USP) e o Laboratório do Dr. Christopher Dick (Departamento de Ecologia e Biologia Evolutiva) da Universidade de Michigan (UM). Enquanto o Laboratório da Dra. Lohmann (USP) irá cobrir todos os gastos do projeto, o laboratório do Dr. Dick (UM) irá permitir a utilização de equipamentos para a geração e análise dos dados. A análise dos dados será realizada em ambas instituições, e o artigo será escrito conjuntamente entre os membros do projeto. (AU) | |
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