| Processo: | 13/12633-8 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de outubro de 2013 |
| Data de Término da vigência: | 23 de março de 2018 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal |
| Pesquisador responsável: | Lúcia Garcez Lohmann |
| Beneficiário: | Alison Gonçalves Nazareno |
| Instituição Sede: | Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 12/50260-6 - Estruturação e evolução da biota amazônica e seu ambiente: uma abordagem integrativa, AP.BTA.TEM |
| Bolsa(s) vinculada(s): | 17/02302-5 - Cruzando os rios amazônicos: um estudo comparativo entre plantas com distintas histórias de vida, BE.EP.PD 15/07141-4 - Testando a hipótese dos rios como barreira biogeográfica para espécies de plantas da Amazônia, BE.EP.PD |
| Assunto(s): | Sequenciamento de nova geração Estruturas genéticas Filogeografia Polimorfismo de um único nucleotídeo Amazônia |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Estrutura Genética | RAD-seq | sequenciamento de nova geração | SNPs | Filogeografia |
Resumo A Amazônia representa um dos Biomas mais diversos no Planeta. Apesar disso, pouco ainda se sabe sobre os processos ecológicos e evolutivos que levaram às altas taxas de diversificação, manutenção e distribuição das espécies nesta região. Dada a magnitude deste Bioma, estudos de caso, como o de organismos que apresentam padrões de distribuição fragmentada, formando ilhas na paisagem, são ideais para testar hipóteses sobre os mecanismos ecológicos e evolutivos envolvidos na origem de distribuições disjuntas. O gênero Pagamea (Rubiaceae), por exemplo, apresenta espécies que se distribuem em habitats específicos (campinas e campinaranas) representando um excelente modelo para estudos populacionais. Usando a técnica de sequenciamento massivo de sequências associadas a sítios de restrição (RAD-seq, Restriction site Associated DNA sequencing) para identificar marcadores SNPs (Single Nucleotide Polimorphism), determinaremos a história filogeográfica de P. coriacea. Para elucidá-la, serão testadas as hipóteses associadas a grandes rios como possíveis barreiras geográficas, bem como hipóteses associadas ao papel da distribuição espacial das campinaranas de diferentes tamanhos e padrões de isolamento geográfico na diferenciação genética entre as populações de P. coriacea. O padrão e o tempo de divergência filogenética entre populações de P. coriacea também serão inferidos, explorando o potencial de diferenciação adaptativa. Este projeto de pesquisa está vinculado ao projeto "Estruturação e Evolução da Biota Amazônica e seu ambiente: Uma abordagem integrativa" (FAPESP: 2012/50260-6). (AU) | |
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