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Dinâmica estrutural e mecanismos moleculares envolvidos na agregação da alfa-sinucleína

Processo: 17/19077-4
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Pesquisa
Data de Início da vigência: 01 de junho de 2018
Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2019
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Ana Lígia Barbour Scott
Beneficiário:Ana Lígia Barbour Scott
Pesquisador Anfitrião: Ivet Bahar
Instituição Sede: Centro de Matemática, Computação e Cognição (CMCC). Universidade Federal do ABC (UFABC). Ministério da Educação (Brasil). Santo André , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: University of Pittsburgh (Pitt), Estados Unidos  
Assunto(s):Simulação de dinâmica molecular   Modelagem molecular   alfa-Sinucleína
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:agregação | Alfa-sinucleína | Análise de Modos Normais | Dinâmica Molecular | Modelagem molecular | Modelagem Molecular

Resumo

Apesar do grande número de pesquisas que vêm sendo conduzidas sobre as patologias neurodegenerativas nas últimas décadas, não há ainda uma boa compreensão e consenso sobre as causas dessas patologias do ponto de vista celular/molecular. Uma melhor compreensão dos mecanismos moleculares das proteínas que participam de várias doenças neurodegenerativas (como doenças de Alzheimer e Parkinson, esclerose lateral amiotrófica, etc.) pode auxiliar no desenvolvimento de novos medicamentos e tratamentos. Uma das principais características patológicas presentes em todos os distúrbios citados anteriormente é a presença de agregados de proteínas insolúveis. Um desses agregados, conhecido como corpos de Lewy, está associado à demência de Parkinson, Parkinson e demência de corpo de Lewy. Os corpos de Lewy são constituídos principalmente pela proteína alfa-sinucleína que apresenta uma variedade de conformações: monoméricas e não estruturadas em solução. Este projeto de pesquisa tem como objetivo compreender a dinâmica da estrutura da alfa-sinucleína (proteínas nativas e mutantes), mecanismos de agregação e interação da mesma com, membrana por meio de simulações computacionais, utilizando diversas técnicas: como modos normais, dinâmica molecular, coarse grained e mineração de dados. Nos três últimos anos, Luis Paulo Scott foi financiado pela Fapesp em sua pesquisa sobre a compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos com patologias neurodegenerativas e formação de agregados por meio da combinação de duas metodologias computacionais diferentes: análise de modo normal e simulações de dinâmica molecular. Ivet Bahar é uma especialista de renome no estudo de dinâmicas estruturais (movimentos funcionais e mudanças conformacionais). No momento, ela é Diretora de um centro de pesquisa multi-institucional, o Centro Nacional de Modelagem Multiscalar de Sistemas Biológicos (MMBioS), cujo objetivo é compreender a dinâmica de biomoléculas e macromoléculas/sistemas envolvidos na sinalização e regulação neuronal. Este estágio sabático seria uma continuação do estágio sabático de 2013 realizado na França, e permitirá o desenvolvimento profissional do Dr. Luis Paulo Barbour Scott no estudo da dinâmica de biomoléculas em relação a patologias neurodegenerativas, melhorando assim seu próprio grupo de pesquisa. É importante ressaltar que Profa. Ivet Bahar pagará a despesas para o período de janeiro de 2018 até maio 2018. Dessa forma, o pesquisador necessita de apenas mais 7 meses de bolsa da Fapesp para poder realizar seu estágio sabático de um ano. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BOMEDIANO CAMILLO, LIVIA DE MORAES; FERREIRA, GRAZIELE CRISTINA; ALVES DURAN, ADRIANA FELICIANO; SANTOS DA SILVA, FLAVIA RIBEIRO; GARCIA, WANIUS; SCOTT, ANA LIGIA; SASAKI, SERGIO DAISHI. Structural modelling and thermostability of a serine protease inhibitor belonging to the Kunitz-BPTI family from the Rhipicephalus microplus tick. Biochimie, v. 181, p. 226-233, . (11/07001-7, 17/19077-4, 18/11874-5, 17/17275-3)
KRIEGER, JAMES M.; DORUKER, PEMRA; SCOTT, ANA LIGIA; PERAHIA, DAVID; BAHAR, IVET. Towards gaining sight of multiscale events: utilizing network models and normal modes in hybrid methods. CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY, v. 64, p. 34-41, . (17/19077-4)