| Processo: | 17/20734-0 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de janeiro de 2018 |
| Data de Término da vigência: | 31 de março de 2018 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular |
| Pesquisador responsável: | Vadim Viviani |
| Beneficiário: | Danilo Trabuco do Amaral |
| Supervisor: | Yoshihiro Ohmiya |
| Instituição Sede: | Centro de Ciências e Tecnologias para a Sustentabilidade (CCTS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Hokkaido (AIST), Japão |
| Vinculado à bolsa: | 14/20176-9 - Transcriptoma das lanternas de larva e adulto e do corpo gorduroso de larva de Elateroidea (Coleoptera), BP.PD |
| Assunto(s): | Genomas Análise de sequência de DNA Phengodidae Bioluminescência |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | assembly | Genome | Phengodidae | Genoma |
Resumo Bioluminescência, a emissão de luz fria produzida por organismos vivos, tem sido amplamente encontrada no habitat terrestre na superfamília Elateroidea. O mecanismo da produção de luz nesta superfamília é bem conhecido, no entanto estudos sobre organização e tamanho do genoma desses organismos ainda não foram discutidos. Os projetos de genômica funcional ajudam a identificar importantes elementos estruturais e funcionais e variações genéticas nesses genomas, além de identificar grupos gênicos envolvidos em funções semelhantes no mesmo cromossomo. Assim, para melhorar/aumentar a informação sobre a organização do genoma, tamanho e eventos de duplicação em espécies de Elateroidea, realizaremos o sequenciamento do genoma do Phrixothrix hirtus (Phengodidae). Serão utilizadas neste estudo duas abordagens distintas: o sequenciamento paired-end de 600 pb e o sequenciamento de uma biblioteca mate-pair de fragmentos de tamanho de 5 Kb, ambos na plataforma Illumina HiSeq. Essas duas abordagens devem ajudar a melhorar a qualidade do genoma montado. (AU) | |
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