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Aprendizagem de máquina para análises preditivas em ovinos Santa Inês: exemplo de aplicação para predizer animais resistentes, resilientes e susceptíveis

Processo: 20/03575-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2021
Data de Término da vigência: 31 de julho de 2022
Área de conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Claudia Cristina Paro de Paz
Beneficiário:Luara Afonso de Freitas Januário
Supervisor: Guilherme Jordão de Magalhães Rosa
Instituição Sede: Instituto de Zootecnia. Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Nova Odessa , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: University of Wisconsin-Madison (UW-Madison), Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:18/01540-2 - Predição dos valores genômicos utilizando modelos Bayesianos e de redes neurais para características de resistência a endoparasitas em ovinos Santa Inês, BP.DR
Assunto(s):Ovinocultura   Ovelha Santa Inês   Análise multivariada   Aprendizado computacional   Nematoda   Predição de genes
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:análise multivariada | Random Forest | Redes neurais | Machine Learning

Resumo

Atualmente o maior problema para a expansão da ovinocultura de corte são as infecções por nematódeos gastrintestinais, podendo em algumas situações inviabilizar economicamente as criações. Portanto, este estudo tem por objetivo comparar de predição dos métodos Multilayer perceptron (MPL), Random Forest (RF) e Linear Discriminant Analysis (LDA) com a regressão logística multinominal para prever animais resistentes, resilientes e susceptíveis aos endoparasitas. O banco de dados contém 3.896 registros de 974 animais da raça Santa Inês. As características a serem avaliadas como preditores para a classificação em resistente, resiliente e susceptível serão peso corporal, medidas corporais (altura de garupa, altura de cernelha, comprimento corporal, perímetro torácico e largura de garupa), escore de condição corporal, vermifugação, fazenda, idade, estação de nascimento, estação de pesagem e sexo. Como variável resposta dos modelos de predição serão utilizadas as classificações dos animais em resilientes (1), susceptíveis (2) e resistentes (3). As análises serão realizadas por meio do software R. (AU)

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Publicações científicas (4)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
FREITAS, LUARA; FERREIRA, RAFAEL; SAVEGNAGO, RODRIGO; DOREA, JOAO R.; ROSA, GUILHERME J. J. M.; PAZ, CLAUDIA. Computer Vision System to Predict Famacha (c) Degree in Sheep from Ocular Conjunctiva Images. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, v. 100, p. 1-pg., . (16/14522-7, 18/01540-2, 20/03575-8)
FREITAS, LUARA; SAVEGNAGO, RODRIGO; CARVALHO ALVES, ANDERSON A.; COSTA, RICARDO; ROSA, GUILHERME J. J. M.; PAZ, CLAUDIA. Classification Performance of Multinomial Logistic Regression for Identifying Resistance, Resilience, and Susceptibility to Gastrointestinal Nematode Infections in Sheep. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, v. 100, p. 1-pg., . (16/14522-7, 18/01540-2, 20/03575-8)
DO BEM, RICARDO DUTRA; DE FREITAS, LUARA AFONSO; MENEGATTO, LEONARDO SARTORI; COSTA, KARINE ASSIS; DA COSTA, RICARDO LOPES DIAS; SAVEGNAGO, RODRIGO PELICIONI; STAFUZZA, NEDENIA BONVINO; DE PAZ, CLAUDIA CRISTINA PARO. Estimates of genetic parameters for indicator traits of resistance to gastrointestinal nematodes and growth traits in Santa Ines sheep. Small Ruminant Research, v. 224, p. 6-pg., . (16/14522-7, 20/03575-8, 18/01540-2, 17/50339-5, 12/15982-0)
FREITAS, LUARA A.; FERREIRA, RAFAEL E. P.; SAVEGNAGO, RODRIGO P.; DOREA, JOAO R. R.; STAFUZZA, NEDENIA B.; ROSA, GUILHERME J. M.; PAZ, CLAUDIA C. P.. Image analysis to automatically classify anemia based on Famacha score in sheep using ocular conjunctiva images. TRANSLATIONAL ANIMAL SCIENCE, v. 7, n. 1, p. 8-pg., . (16/14522-7, 20/03575-8, 18/01540-2, 17/50339-5, 12/15982-0)