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Genética de paisagens e genômica comparativa: uma abordagem integrada no estudo evolutivo de invertebrados marinhos

Processo:21/06738-8
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Jovens Pesquisadores - Fase 2
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2022
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2027
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Sónia Cristina da Silva Andrade
Beneficiário:Sónia Cristina da Silva Andrade
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:São Paulo
Pesquisadores associados: Gonzalo Giribet ; Hugo Benitez ; Maikon Di Domenico ; Marcelo Dottori
Vinculado ao auxílio:15/20139-9 - Genética de paisagens marinha e avaliação de perfis de expressão em invertebrados marinhos na costa sudeste brasileira, AP.JP
Auxílio(s) vinculado(s):26/16468-1 - Ampliação da escala biogeofísica na morfodinâmica de praias arenosas: o uso de genômica comparativa para integrar o mundo microscópico à geofísica costeira, AV.BR
23/01413-9 - Investigação da cadeia de Vitória e Trindade como barreira ao fluxo gênico em Colpomenia sinuosa (Ectocarpales, Phaeophyceae), AP.R
Bolsa(s) vinculada(s):25/11481-7 - A transição para o ambiente terrestre e de água doce em Lophotrochozoa, com foco no filo Nemertea: uma análise genômica e funcional, BP.DR
25/25051-4 - Diversidade do viroma das espécies de Ozobranchus spp. na transmissão de ChHV5 em tartarugas marinhas, BP.MS
25/22244-6 - O parasitismo em Cnidaria: evolução dos genes envolvidos no modo de vida parasitário, nas respostas imune e dos genes codificadores de toxinas, BP.PD
+ mais bolsas vinculadas 25/00613-0 - Investigando a tribo Rhinotragini (Coleoptera, Cerambycidae, Cerambycinae) através da revisão taxonômica de "Chariergodes" Zajciw, 1963 e análise genômica comparativa de gêneros próximos., BP.MS
24/20492-0 - Análises morfológicas e molecular da espécie Bellactis ilkalyseae (Cnidaria: Actiniaria) do litoral brasileiro, com a (re)descrição da espécie, BP.IC
24/21688-5 - Diversidade genômica de Ozobranchus (Ozobranchidae: Hirudinida): padrões de fluxo gênico e relações de parentesco da espécie Ozobranchus margoi, parasita de tartarugas marinhas na costa brasileira, BP.IC
24/16456-8 - Capacidades regenerativas em Spiralia: uma abordagem integrada para o estudo de processos regenerativos, BP.IC
21/12924-9 - Investigação da cadeia de Vitória e Trindade como barreira ao fluxo gênico em Colpomenia sinuosa (Ectocarpales, Phaeophyceae), BP.PD
22/14490-9 - Genômica de Coronula diadema e Xenobalanus globicipitis e identificação de genes relacionados à associação ecológica entre cracas e cetáceos, BP.PD
22/13979-4 - A história evolutiva dos Piolhos-de-Baleia: de adaptações específicas à filogenia da família, BP.PD
22/12534-9 - Filogeografia e padrão de diversidade genética em espécies da meiofauna, BP.IC
22/10285-1 - Diversidade da comunidade de meiofauna de corpo mole do Sudeste brasileiro, BP.IC - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Biologia evolutiva  Genética populacional  Genômica comparativa  Filogenia molecular  Demografia histórica  Meiofauna 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:conectividade e demografia histórica | Genética de populações | genômica comparativa | Meiofauna | organismos epibiontes | Sistemática Molecular | Biologia Evolutiva

Resumo

Inferir como as relações históricas entre populações naturais se reflete nos padrões de variabilidade genética é um dos desafios da disciplina de genética de paisagens. Essa abordagem permite a compreensão das relações entre a distribuição das populações na matriz geográfica e o fluxo gênico, regulado pelas características ambientais e bionômicas. Uma das muitas possibilidades dentro da genética de paisagens marinha é a análise de associação entre os dados dos marcadores genéticos com potencial papel funcional e características descritivas ambientais. Entretanto, essa associação tem um alcance limitado, uma vez que em organismos não modelo a anotação dos locos associados é limitada pelos bancos de dados. Para resolver esse problema, análises comparativas genômicas podem ser empregadas para estudar a base genética da evolução fenotípica/funcional do caráter. Nesse contexto, a presente proposta explora três aspectos potencialmente fundamentais no estabelecimento de uma ponte entre diversidade genética e traços adaptativos em dois ambientes marinhos restritivos e pouco estudados. Primeiramente, caracterizar e entender a um nível genômico/transcriptômico as diferenças interespecíficas da resposta a pressões ambientais. Em segundo lugar, avaliar a distribuição da variabilidade genética acompanhada por dados ambientais e de circulação oceânica. Finalmente, usando abordagens filogenéticas, ferramentas comparativas (PhyloG2P, PhyloAcc), dados genômicos, transcriptomas e marcadores UCEs, serão testadas associações evolutivas entre diversificação de linhagens e traços adaptativos/funcionais, identificando e distinguindo a similaridade causada por evolução convergente da causada pela ancestralidade compartilhada. (AU)

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Publicações científicas (6)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
CORTEZ, THAINA; MARANGONI, GIULIA; ANDRADE, SONIA CRISTINA DA SILVA; DI DOMENICO, MAIKON. Sediment effects on interstitial faunal distribution in Brazilian sandy beaches: a multi-phylum approach. MARINE AND FRESHWATER RESEARCH, v. 76, n. 2, p. 11-pg., . (21/06738-8)
LOPES, CELINE S. S.; IWAMA, RAFAEL E.; CORTEZ, THAINA; ANDRADE, SONIA C. S.; KLOMPEN, ANNA M. L.; AUDINO, JORGE A.; MACRANDER, JASON; REITZEL, ADAM M.; NAGATA, RENATO M.; LANNA, EMILIO; et al. Evolutionary insights into toxins diversity in Ceriantharia (Cnidaria; Anthozoa). TOXICON-X, v. 27, p. 13-pg., . (22/16193-1, 17/50028-0, 19/03552-0, 21/06738-8)
BEZERRA, FLAVIA O.; IWASA-ARAI, TAMMY; SANTOS, CAMILLA A.; MIGUEL, CAMILA; ANDRADE, SONIA C. S.. The role of host sea turtles in the dispersal of amphipod epibionts. Biological Journal of the Linnean Society, v. 145, n. 3, p. 16-pg., . (21/06738-8)
IWASA-ARAI, TAMMY; LINSE, KATRIN; ANDRADE, SONIA C. S.; GIRIBET, GONZALO. Unpouching Peracarida relationships with ultraconserved elements. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 216, p. 12-pg., . (21/06738-8, 24/06934-0)
SONODA, GABRIEL GONZALEZ; TOBARUELA, ERIC DE CASTRO; NORENBURG, JON; FABI, JOAO PAULO; ANDRADE, SONIA C. S.. Venomous Noodles: The Evolution of Toxins in Nemertea through Positive Selection and Gene Duplication. TOXINS, v. 15, n. 11, p. 27-pg., . (15/20139-9, 18/12502-4, 21/06738-8, 20/06467-1)
CORTEZ, THAINA; CANDIDO, TAYNARA; DI DOMENICO, MAIKON; ANDRADE, SONIA C. S.. Hidden but not Forgotten: Molecular Diversity and Species Delimitation of Proseriata (Platyhelminthes: Rhabditophora) across the Brazilian Coastline, with Focus on Genus Kata. ZOOLOGICAL STUDIES, v. 64, p. 10-pg., . (21/06738-8)