Identificação de inibidores contra toxinas esfoliativas estafilocócicas por meio de técnicas computacionais

Resumo

Várias espécies de Staphylococcus expressam toxinas esfoliativas (ETs), que atuam como fatores-chave de virulência facilitando a invasão e infecção do hospedeiro. S. aureus é um patógeno notório que pode produzir diferentes ETs (ETA a ETE) causando doenças graves em humanos e animais de valor econômico, como a síndrome da pele escaldada estafilocócica (SSSS) e mastite. Outras espécies, por exemplo, S. sciuri e S. hyicus, podem produzir uma toxina denominada ExhC, que causa epidermite exsudativa (EE) em porcos recém-nascidos e necrose celular in vitro. As ETs mais conhecidos são as glutamil endopeptidases (GEPs) que clivam a desmogleína-1(Dsg-1), uma proteína da pele crítica para a adesão célula-célula. Em geral, as ETs possuem uma especificidade bem afinada pelo substrato e muito e provavelmente requerem ativação para atingir a atividade catalítica total após a interação por meio de um exossítio com uma região específica da Dsg-1. Nesta proposta pretendemos descobrir novos inibidores de ETA, ETE e ExhC empregando abordagens in silico de última geração. Mais especificamente, utilizaremos técnicas baseadas em modelos farmacofóricos e de ancoramento molecular, a fim de fazer a triagem de grandes coleções de compostos semelhantes a drogas comercialmente disponíveis e desobrir substâncias com o potencial de se ligar aos sítios ativos e associados à necrose das ETs estudadas. Portanto, as moléculas identificadas poderão inibir as atividades esfoliativas e necróticas dessas enzimas. Simulações de dinâmica molecular (MD) serão conduzidas para abordar a flexibilidade dos sítios de ligação selecionados. Além disso, usaremos ferramentas in silico para modificar substratos peptídicos conhecidos das ETs a fim de transformá-los em inibidores potentes. As melhores substâncias candidatas serão adquiridas e avaliadas in vitro em relação à sua atividade inibitória contra os alvos selecionados. (AU)