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Prospecção química e estudos metabolômicos na diversidade microbiológica em cavernas

Processo: 22/05378-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2022
Data de Término da vigência: 31 de julho de 2024
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
Pesquisador responsável:Norberto Peporine Lopes
Beneficiário:Natália Naomi Kato
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:20/02207-5 - Inventariando o metabolismo secundário através da metabolômica: contribuição para a valoração da biodiversidade brasileira, AP.BTA.TEM
Assunto(s):Cavernas   Ecologia química   Espectrometria de massas   Metabolômica   Micro-organismos   Produtos naturais
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Cavernas | Ecologia Química | Espectrometria de massas | Metabolomica | microrganismos | Produtos Naturais | Produtos Naturais

Resumo

As cavernas são patrimônios naturais e um ecossistema capaz de abrigar uma rica biodiversidade, incluindo a microbiota. Fatores abióticos e bióticos modulam o equilíbrio ecológico e garante a singularidade de cada ecossistema. Com o avanço das técnicas de sequenciamento genômico e a metagenômica permitiram o aprimoramento da classificação taxonômica dos organismos habitantes em cavernas, revelando assim, uma indiscutível diversidade microbiológica. A microbiota de cavernas é caracterizada por sobreviver e desenvolver em zonas de baixa disponibilidade de nutrientes e ausência de luz e, é responsável por diversas funções ecológicas. Outro papel importante dos microrganismos, em destaque as bactérias, são como fonte natural de obtenção de metabólitos bioativos com potencial farmacológico. Com o intuito de explorar a diversidade biológica e química de microbiotas de cavernas, serão correlacionados os dados genômicos, perfil químico e seus efeitos biológicos de cepas bacterianas isoladas de zona afótica de caverna ferruginosa. O sequenciamento genômico 16S rRNA fornecerá a classificação taxonômica das bactérias isoladas. Para caracterização do perfil químico serão submetidas a análise em cromatografia líquida de alta eficiência acoplada a espectrometria de massas (CLAE-EM/EM). Em paralelo, os extratos serão testados em ensaios de citotoxicidade in vitro em linhagens celulares tumorais. Baseados no perfil químico e na atividade citotóxica serão realizados testes estatísticos, utilizando a metabolômica como ferramenta, que possibilitará a predição dos compostos ativos e a elencar as bactérias produtoras desses metabólitos. Os resultados obtidos promovem as análises metabolômicas como estratégia para busca de compostos ativos com potencial farmacológico em microbiota de cavernas.

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