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Desenvolvimento de um pipeline para contínua melhoria de anticorpos monoclonais para uso terapêutico nas doenças causadas por influenza e SARS-CoV-2

Processo: 23/11920-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2023
Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2025
Área de conhecimento:Interdisciplinar
Pesquisador responsável:Maria Carolina Quartim Barbosa Elias Sabbaga
Beneficiário:Vinicius Carius de Souza
Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:21/11944-6 - Contínuo aprimoramento de vacinas: Centro para Vigilância Viral e Avaliação Sorológica (CeVIVAS), AP.CCD
Assunto(s):Anticorpos   Simulação de dinâmica molecular   Viroses   Biologia computacional
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Anticorpos | ddocking proteína-proteína | Dinâmica Molecular | Doenças virais | predição estrutural de proteínas | bioinformática

Resumo

As doenças virais representam um desafio contínuo à saúde pública global. O projeto CeVIVAS tem realizado uma constante vigilância genômica dos vírus Influenza e SARS-CoV-2 circulantes no Estado de SP, no país e em países vizinhos. Os dados permitem desde a história evolutiva desses vírus até o conhecimento de variantes virais e a capacidade protetora das vacinas disponíveis para a população. A integração da ciência experimental com as ferramentas computacionais representa uma abordagem inovadora para o tratamento de doenças virais. A compreensão das interações moleculares entre os anticorpos e os vírus, aliada ao uso de métodos computacionais, oferece uma perspectiva promissora para o desenvolvimento de terapias mais eficazes e acessíveis no campo da imunoterapia viral, contribuindo significativamente para a saúde pública global. Os anticorpos monoclonais têm emergido como uma potente estratégia terapêutica, com os fragmentos de anticorpos scFv/Fab ganhando destaque devido a sua alta especificidade e versatilidade. Neste contexto, o presente estudo tem como objetivo utilizar métodos computacionais para (i) identificar CDRs (Complementarity-Determining Regions) produzidas em humanos em resposta a infecção/vacina viral; (ii) avaliar a interação das CDRs identificadas com as estruturas das proteínas antigênicas de cepas virais circulantes (detectadas na vigilância genômica estabelecida no projeto CeVIVAS); (iii) predição e otimização estrutural de anticorpos scFv/Fab baseados nos dados obtidos nos objetivos (i) e (ii), visando avançar no tratamento de doenças causadas pelos vírus estudados no projeto.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BRCKO, ISABELA CARVALHO; DE SOUZA, VINICIUS CARIUS; RIBEIRO, GABRIELA; LIMA, ALEX RANIERI JERONIMO; MARTINS, ANTONIO JORGE; BARROS, CLAUDIA RENATA DOS SANTOS; DE CARVALHO, ENEAS; PEREIRA, JAMES SIQUEIRA; DE LIMA, LOYZE PAOLA OLIVEIRA; VIALA, VINCENT LOUIS; et al. Comprehensive molecular epidemiology of influenza viruses in Brazil: insights from a nationwide analysis. VIRUS EVOLUTION, v. 11, n. 1, p. 17-pg., . (21/11944-6, 23/07688-0, 23/11920-5)