Speciomics as a concept involving chemical speciation and omics

Autor(es)

Arruda, Marco Aurelio Zezzi ; Jesus, Jemmyson Romario de ; Blindauer, Claudia Andrea ; Stewart, Alan James

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: JOURNAL OF PROTEOMICS; v. 263, p. 8-pg., 2022-07-15.

Resumo

The study of chemical speciation and the refinement and expansion of omics-based methods are both consolidated and highly active research fields. Although well established, such fields are extremely dynamic and are driven by the emergence of new strategies and improvements in instrumentation. In the case of omics-based studies, subareas including lipidomics, proteomics, metallomics, metabolomics and foodomics have emerged. Here, speciomics is being proposed as an "umbrella" term, that incorporates all of these subareas, to capture studies where the evaluation of chemical species is carried out using omics approaches. This paper contextualizes both speciomics and the speciome, and reviews omics applications used for species identification through examination of proteins, metalloproteins, metabolites, and nucleic acids. In addition, some implications from such studies and a perspective for future development of this area are provided.Significance: The synergic effect between chemical speciation and omics is highlighted in this work, demonstrating an emerging area of research with a multitude of possibilities in terms of applications and further developments. This work not only defines and contextualizes speciomics and individual speciomes, but also demonstrates with some examples the great potential of this new interdisciplinary area of research. (AU)

• Processo FAPESP: 20/08543-7 - Um kit de ferramentas especiômicas para investigar alterações mediadas por ácidos graxos na especiação plasmática de zinco e seus efeitos fisiológicos
• Beneficiário: Marco Aurelio Zezzi Arruda
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 19/00018-3 - Estudo de suportes inertes como matriz sólida para a quantificação de Zn e Cu em anéis e espeleotemas utilizando LA-ICP-MS
• Beneficiário: Pedro dos Santos Moreau
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 18/25207-0 - Nanometalômica aplicada ao cultivo da soja para estudar os efeitos das nanopartículas relacionadas a metal
• Beneficiário: Marco Aurelio Zezzi Arruda
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 14/50867-3 - INCT 2014: Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Bioanalítica
• Beneficiário: Marco Aurelio Zezzi Arruda
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 17/50085-3 - PIRE: educação e pesquisa em clima das Américas usando os exemplos de anéis de árvores e espeleotemas (PIRE-CREATE)
• Beneficiário: Francisco William da Cruz Junior
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 19/24445-8 - EMU concedido no processo 2018/25207-0: espectrômetro de massas com plasma indutivamente acoplado
• Beneficiário: Marco Aurelio Zezzi Arruda
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários