Caenorhabditis elegans (C. elegans) sample preparation for metabolomics and lipidomics analysis - A review

Autor(es)

Santoro, Adriana Leandra ; Vendramini, Pedro H. ; Braga, Deisi L. ; Martins, Lucas Gelain ; Dos Santos, Gabriel F. ; Lima, Gesiane S. ; Tasic, Ljubica ; Mori, Marcelo A.

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: TRAC-TRENDS IN ANALYTICAL CHEMISTRY; v. 169, p. 11-pg., 2023-10-25.

Resumo

Caenorhabditis elegans (C. elegans) is a powerful model organism which has been extensively characterized at the genetic and cellular levels and used to study various biological processes. However, less is known about how metabolic pathways operate in C. elegans and how metabolites participate in worm's physiology. Metabolomics and lipidomics have emerged as valuable tools for understanding C. elegans biology and its association with physiological and pathological conditions in humans. Metabolomics and lipidomics methods are diverse and lead to different outcomes depending on a number of variables, including sample preparation, metabolite extraction, the method of detection and data analysis. In this Review, the main steps involved in C. elegans lipidomics and metabolomics analyses are presented, directing particular attention to the advantages and drawbacks of each method of sample preparation and processing in terms of simplicity and metabolite coverage, and also listing the most frequently used protocols and their applications. (AU)

• Processo FAPESP: 13/07607-8 - CMPO - Centro Multidisciplinar de Pesquisa em Obesidade e Doenças Associadas
• Beneficiário: Licio Augusto Velloso
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
• Processo FAPESP: 21/08354-2 - A ação recíproca do sistema imune e do metabolismo como principal determinante do processo de envelhecimento
• Beneficiário: Marcelo Alves da Silva Mori
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 17/01184-9 - CAMeLEOm: análise entre espécies dos efeitos metabólicos, na expectativa de vida e ômicas de miméticos de restrição dietética
• Beneficiário: Marcelo Alves da Silva Mori
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 20/06057-8 - Explorando novos mecanismos de comunicação intercelular em doenças metabólicas
• Beneficiário: Adriana Leandra Santoro
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 18/11792-9 - Caracterização em C. elegans de novos genes envolvidos no envelhecimento e nos mecanismos conservados de miméticos de restrição dietética
• Beneficiário: Deisi Lilian Braga Shimo
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto