Construction and preliminary characterization of a river buffalo bacterial artificial chromosome library

Autor(es)

Stafuzza, N. B. ^[1] ; Abbey, C. A. ^[2] ; Gill, C. A. ^[2] ; Womack, J. E. ^[3] ; Amaral, M. E. J. ^[1]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Estadual Sao Paulo Julio de Mesquita Filho, Inst Biociencias Letras & Ciencias Exatas, Dept Biol, Sao Jose Do Rio Preto, SP - Brazil

^[2] Texas A&M Univ, Dept Anim Sci, College Stn, TX 77843 - USA

^[3] Texas A&M Univ, Dept Vet Pathobiol, College Stn, TX - USA

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Genetics and Molecular Research; v. 11, n. 3, p. 3013-3019, 2012.
• Citações Web of Science: 9

Resumo

River buffalo genome analyses have advanced significantly in the last decade, and the genome sequence of Bubalus bubalis will be available shortly. Nonetheless, large-insert DNA library resources such as bacterial artificial chromosomes (BAC) are still required for validation and accurate assembly of the genome sequence. We constructed a river buffalo BAC library containing 52,224 clones with an average insert size of 97 kb, representing 1.7 x coverage of the genome. This genomic resource for river buffalo will facilitate further studies in this economically important species allowing for instance, whole genome physical mapping and isolation of genes and gene clusters, contributing to the elucidation of gene organization and identification of regulatory elements. (AU)

• Processo FAPESP: 11/02478-0 - Análise molecular da região MHC de búfalo utilizando ferramentas genômicas de última geração
• Beneficiário: Nedenia Bonvino Stafuzza
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 06/59606-1 - Construcao de uma biblioteca genomica do bufalo de rio para caracterizacao da estrutura dos genes relacionados com producao e qualidade de leite e sua comparacao com o genoma bovino.
• Beneficiário: Nedenia Bonvino Stafuzza
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 08/10725-4 - Estudos do Genoma de Búfalo: aplicação dos recentes mapas do genoma bubalino para caracterizar genes de interesse econômico e biológico utilizando como ferramenta uma biblioteca de DNA.
• Beneficiário: Maria Elisabete Jorge Amaral
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular