Automatic Segmentation and Classification of Human Intestinal Parasites From Microscopy Images

Autor(es)

Suzuki, Celso T. N. ^[1] ; Gomes, Jancarlo F. ^[1] ; Falcao, Alexandre X. ^[1] ; Papa, Joao P. ^[2] ; Hoshino-Shimizu, Sumie ^[3]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Estadual Campinas, Inst Comp, BR-13084971 Sao Paulo - Brazil

^[2] Univ Estadual Paulista, Dept Comp Sci, BR-05508900 Sao Paulo - Brazil

^[3] Univ Sao Paulo, Fac Pharmaceut Sci, BR-66318 Sao Paulo - Brazil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: IEEE Transactions on Biomedical Engineering; v. 60, n. 3, p. 803-812, MAR 2013.
• Citações Web of Science: 22

Resumo

Human intestinal parasites constitute a problem in most tropical countries, causing death or physical and mental disorders. Their diagnosis usually relies on the visual analysis of microscopy images, with error rates that may range from moderate to high. The problem has been addressed via computational image analysis, but only for a few species and images free of fecal impurities. In routine, fecal impurities are a real challenge for automatic image analysis. We have circumvented this problem by a method that can segment and classify, from bright field microscopy images with fecal impurities, the 15 most common species of protozoan cysts, helminth eggs, and larvae in Brazil. Our approach exploits ellipse matching and image foresting transform for image segmentation, multiple object descriptors and their optimum combination by genetic programming for object representation, and the optimum-path forest classifier for object recognition. The results indicate that our method is a promising approach toward the fully automation of the enteroparasitosis diagnosis. (AU)

• Processo FAPESP: 04/11218-8 - Segmentacao de imagens de parasitos intestinais do homem.
• Beneficiário: Celso Tetsuo Nagase Suzuki
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 08/50090-8 - Análise automatizada de enteroparasitos para finalidade diagnóstica
• Beneficiário: Jancarlo Ferreira Gomes
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 09/16206-1 - Novas tendências em reconhecimento de padrões baseado em floresta de caminhos ótimos
• Beneficiário: João Paulo Papa
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 03/14096-8 - Analise de imagens de parasitos intestinais do homem.
• Beneficiário: Alexandre Xavier Falcão
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 08/57428-4 - Automatização do diagnóstico de parasitos intestinais do homem por análise de imagens
• Beneficiário: Alexandre Xavier Falcão
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 06/61385-3 - Análise de imagens de parasitos intestinais do homem
• Beneficiário: Celso Tetsuo Nagase Suzuki
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico