Automated molecule editing in molecular design

Autor(es)

Kenny, Peter W. ^[1] ; Montanari, Carlos A. ^[1] ; Prokopczyk, Igor M. ^[1] ; Sala, Fernanda A. ^[1] ; Sartori, Geraldo Rodrigues ^[1]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Sao Paulo, Grp Estudos Quim Med NEQUIMED, Inst Quim Sao Carlos, BR-13566590 Sao Carlos, SP - Brazil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Journal of Computer-Aided Molecular Design; v. 27, n. 8, p. 655-664, AUG 2013.
• Citações Web of Science: 6

Resumo

The ability to modify chemical structures in an automated and controlled manner is useful in molecular design. This Perspective introduces the MUDO molecule editor and shows how automated molecule editing can be used to standardize structures, enumerate tautomeric and ionization states, identify matched molecular pairs. Unlike its predecessor Leatherface, MUDO can also process 3D structures and this capability can be used to link non-covalently docked ligands to proteins. (AU)

• Processo FAPESP: 11/20572-3 - Planejamento molecular de agentes tripanossomicidas para o tratamento da Doença de Chagas
• Beneficiário: Carlos Alberto Montanari
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Pesquisador Visitante - Internacional
• Processo FAPESP: 11/01893-3 - Otimização de agentes tripanossomatídeos por integração de ensaios in silico, biocalorimétricos e celulares
• Beneficiário: Carlos Alberto Montanari
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular