Busca avançada
Ano de início
Entree
Conteúdo relacionado
(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

PHYLOGENETIC STUDY OF GEITLERINEMA AND MICROCYSTIS ( CYANOBACTERIA) USING PC-IGS AND 16S-23S ITS AS MARKERS: INVESTIGATION OF HORIZONTAL GENE TRANSFER

Texto completo
Autor(es):
Piccin-Santos, Viviane [1, 2, 3] ; Brandao, Marcelo Mendes [4] ; Bittencourt-Oliveira, Maria Do Carmo [1]
Número total de Autores: 3
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Dept Biol Sci, Luiz de Queiroz Coll Agr, BR-13418900 Sao Paulo - Brazil
[2] Sao Paulo State Univ, Inst Biol Sci, BR-13506900 Sao Paulo - Brazil
[3] Res Ctr Chem Biol & Agr CPQBA UNICAMP, Microbial Resources Div, BR-13081970 Campinas, SP - Brazil
[4] Univ Sao Paulo, Dept Genet, Luiz de Queiroz Coll Agr, BR-13418900 Sao Paulo - Brazil
Número total de Afiliações: 4
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: JOURNAL OF PHYCOLOGY; v. 50, n. 4, p. 736-743, AUG 2014.
Citações Web of Science: 3
Resumo

Selection of genes that have not been horizontally transferred for prokaryote phylogenetic inferences is regarded as a challenging task. The markers internal transcribed spacer of ribosomal genes (16S-23S ITS) and phycocyanin intergenic spacer (PC-IGS), based on the operons of ribosomal and phycocyanin genes respectively, are among the most used markers in cyanobacteria. The region of the ribosomal genes has been considered stable, whereas the phycocyanin operon may have undergone horizontal transfer. To investigate the occurrence of horizontal transfer of PC-IGS, phylogenetic trees of Geitlerinema and Microcystis strains were generated using PC-IGS and 16S-23S ITS and compared. Phylogenetic trees based on the two markers were mostly congruent for Geitlerinema and Microcystis, indicating a common evolutionary history among ribosomal and phycocyanin genes with no evidence for horizontal transfer of PC-IGS. Thus, PC-IGS is a suitable marker, along with 16S-23S ITS for phylogenetic studies of cyanobacteria. (AU)

Processo FAPESP: 11/00417-3 - Biologia de sistemas aplicada a agricultura: análise de transcriptomas e interactomas
Beneficiário:Marcelo Mendes Brandao
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Apoio a Jovens Pesquisadores
Processo FAPESP: 07/57338-2 - Cianobactérias potencialmente tóxicas de represas de abastecimento público: uma abordagem taxonômica e de saúde pública
Beneficiário:Viviane Piccin dos Santos
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica