Anotação genômica e validação populacional de SSR-EST e SNP-EST para identificação de genes candidatos no camarão marinho Litopenaeus vannamei (Penaeidae, Decapoda)

Resumo

Litopenaeus vannamei é conhecido como camarão branco do Pacífico, sendo a principal espécie de peneídeo comercializada no mundo. Apesar de seu excelente desempenho em cativeiro, há a preocupação de se manejar adequadamente os plantéis, devido à ausência da introdução de novos pools gênicos que resultam no aumento de endocruzamentos e na diminuição nos níveis de diversidade genética e consequente queda na adaptação destes frente às condições adversas. Neste contexto, marcadores moleculares contidos em regiões expressas do genoma (EST, Expressed Sequence Tags), como os microssatélites ou SSR (Simple Sequence Repeats) e os SNP (Single Nucleotide Polymorphisms), mostram-se úteis no acesso à variabilidade genética dos plantéis, na identificação de locos relacionados a traços de interesse e o no estabelecimento de programas de melhoramento genético baseados na Seleção Assistida por Marcadores (MAS). O desenvolvimento do Projeto Genoma EST do camarão L. vannamei (ShEST) possibilitou a caracterização de milhares de SSR e SNP, sendo grande que parte desses marcadores ainda não foi avaliada populacionalmente nem tampouco possui o com seu produto gênico elucidado. Assim, este trabalho objetiva a descrição dos produtos protéicos de locos SSR-EST e SNP-EST e de suas possíveis vias metabólicas, além da validação dessas marcas em linhagens geneticamente selecionadas para crescimento e resistência. Com base nos produtos descritos na anotação genômica, alguns destes locos que estiverem contidos em genes de interesse serão selecionados para verificação de uma possível associação fenótipo x genótipo. Todos os cruzamentos e mensurações das características de performance serão conduzidos pelas empresas Aquatec e Genearch Aquacultura Ltda (RN, Brasil). Após as análises de associação entre os genótipos e os fenótipos observados espera-se disponibilizar um conjunto de marcadores eficientes para auxiliar no manejo e monitoramento dos estoques desta espécie cultivados no Brasil.