Anotação genômica e validação populacional de SSR-EST e SNP-EST para identificação de genes candidatos no camarão marinho Litopenaeus vannamei (Penaeidae, Decapoda)

Resumo

Litopenaeus vannamei é conhecido como camarão branco do Pacífico, sendo a principal espécie de peneídeo comercializada no mundo. Apesar de seu excelente desempenho em cativeiro, há uma preocupação constante em manejar adequadamente os plantéis. Os endocruzamentos e a diminuição nos níveis de diversidade genética podem comprometer a adaptação dos animais frente a condições adversas. Neste contexto, marcadores moleculares contidos em regiões expressas do genoma (EST, Expressed Sequence Tags), como os microssatélites ou SSR (Simple Sequence Repeats) e os SNP (Single Nucleotide Polymorphisms), podem ser úteis para acessar a variabilidade genética dos plantéis, identificar locos relacionados a traços de interesse e auxiliar no estabelecimento de programas de monitoramento e melhoramento genético. O desenvolvimento do Projeto Genoma EST do camarão L. vannamei (ShEST) possibilitou a caracterização de milhares de SSR-EST e SNP-EST, sendo grande que parte desses marcadores ainda não foi avaliada populacionalmente nem tampouco possui o com seu produto gênico elucidado. Assim, este trabalho objetiva a descrição dos produtos protéicos e de suas possíveis vias metabólicas, além da validação de marcas SSRs e SNPs, obtidas de ESTs do BD de Projeto ShEST, em linhagens selecionadas para crescimento e resistência. Com base nos produtos descritos na anotação genômica, alguns locos que estiverem contidos em genes de interesse serão selecionados para verificação de uma possível associação fenótipo x genótipo. Todos os cruzamentos e mensurações das características de performance serão conduzidos pelas empresas de produção de pós-larva responsáveis pelos programas de cruzamento seletivo. Com este trabalho esperamos disponibilizar um conjunto de informações eficientes para auxiliar no manejo e monitoramento dos estoques desta espécie cultivada no Brasil, e que também possam ser utilizadas em estudos com outras espécies de camarão, as quais consistem em importante recurso sócio-econômico e ecológico. (AU)