Análise genômica em larga escala de elementos repetitivos com foco em cromossomos B do ciclídeo Astatotilapia latifasciata

Resumo

Cromossomos B são elementos supranumerários não homólogos ao conjunto cromossômico A, sendo encontrados em diversos grupos taxonômicos. Sua visão sempre foi associada a de um elemento parasita, porém novos estudos começam a propor modelos sobre sua origem, evolução e função dentro da célula. Sabe-se que sua natureza heterocromática provém da alta carga de elementos repetitivos que os constituem. Análises genômicas prévias e sequenciamento de nova geração foram realizados no ciclídeo africano Astatotilapia latifasciata, evidenciando grande quantidade desses elementos repetitivos em seus cromossomos B. A disponibilidade de novas abordagens de análise, que agrupa famílias de sequências repetitivas em grafos, sem a utilização de genomas de referência, tornou possível a caracterização desses elementos a partir de dados em larga escala de sequenciamento de nova geração. Esta abordagem é aplicada por meio da ferramenta RepeatExplorer, que possibilita a identificação desses elementos para posterior análise. Através de modelo computacional, análises de Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real (qPCR) e Hibridização In Situ de Fluorescência (FISH) o presente projeto visa identificar e caracterizar elementos repetitivos utilizando A. latifasciata como modelo, a fim de esclarecer o papel desses elementos na constituição e evolução dos cromossomos B. (AU)