Cálculos de energia livre para medidas computacionais da entalpia e entropia em interações proteína-ligante

Resumo

As interações nao covalentes em ligações proteina-ligante são fatores chave em grande numero de fenômenos biomoleculares como reconhecimento molecular, comunicação celular e atividade enzimática. Assim, um entendimento profundo do reconhecimento a níveis atômicos e em meios quantitativos é crucial. Em meio das grandezas envolvidas no processo de reconhecimento, a energia livre de interação, tanto quanto suas componentes entálpicas e entrópicas se destacam como fatores de relevancia e como termos de grande dificuldade de obtenção. Nesse projeto, nosso objetivo é usar o software em desenvolvimento no nosso grupo para estimar a energia livre de ligação, em conjunto com a entalpia e com a entropia do sistema usando estatística termodinâmica e simulações de Monte-Carlo. Nós esperamos aprofundar o atual conhecimento em ligações biomoleculares e entregar uma ferramenta útil no design de novos fármacos alcançando um grande raio de aplicações biotecnológicas. (AU)