| Processo: | 10/15376-8 |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Regular |
| Data de Início da vigência: | 01 de abril de 2011 |
| Data de Término da vigência: | 31 de março de 2013 |
| Área do conhecimento: | Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular |
| Pesquisador responsável: | Alessandro Silva Nascimento |
| Beneficiário: | Alessandro Silva Nascimento |
| Instituição Sede: | Centro de Engenharia, Modelagem e Ciências Sociais Aplicadas (CECS). Universidade Federal do ABC (UFABC). Santo André , SP, Brasil |
| Município da Instituição Sede: | Santo André |
| Pesquisadores associados: | Marie Togashi ; Paul Webb |
| Assunto(s): | Receptores ativados por proliferador de peroxissomo PPAR gama Ligantes |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | docking molecular | Energia Livre | interação ligante-receptor | Interação Molecular |
Resumo
O receptor PPAR gama é um fator de transcrição regulado por ligante que desempenha um papel importante na regulação de genes associados ao metabolismo de lipídeos e regulação da glicemia, com importantes consequências para o manejo do diabetes melito do tipo II. Dado o número de estruturas cristalográficas já determinadas para este receptor, propomos, neste projeto, o uso desta informação estrutural para a modelagem de ligantes agonistas deste receptor. Dentre os desafios a serem vencidos, visionamos a prospecção de ligantes através de docking molecular e a avaliação dos modelos para o tratamento do solvente em cálculo de docking, cálculos de variação da energia livre através do método da integração termodinâmica para a otimização de ligantes e, finalmente, medidas experimentais da interação entre ligante e receptor através de espectroscopia de fluorescência e ensaios celulares. Ao final do projeto, esperamos ser capazes de identificar ao menos um novo ligante agonista do receptor PPAR gama, bem como promover avanços na área de modelagem da interação ligante-receptor. (AU)
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