Análise comparativa do genoma, transcriptoma e caracterização fenotípica de linhagens de Salmonella typhimurium isoladas de humanos e alimentos no Brasil

Resumo

Salmonella enterica subsp. enterica sorovariedade Typhimurium (S. Typhimurium) é uma das principais causas de gastroenterite em todo o mundo. Anualmente, ocorrem cerca de 93,8 milhões de casos de salmonelose no mundo ocasionados por Salmonella não-tifóide. Entretanto, no Brasil há poucos estudos que elucidaram possíveis diferenças na patogenicidade, virulência e diversidade genotípica de linhagens de S. Typhimurium isoladas de humanos e alimentos. Esse projeto tem como objetivos comparar o genoma, analisar o transcriptoma e o comportamento frente a testes fenotípicos de linhagens de S. Typhimurium isoladas de humanos e alimentos durante 31 anos em diferentes regiões do Brasil. A análise comparativa do genoma será realizada para 92 linhagens isoladas de humanos (43) e alimentos (49). Para 40 linhagens isoladas de humanos (20) e alimentos (20) serão realizados os testes fenotípicos de invasão a células epiteliais (CACO-2), ensaio de sobrevivência em macrófagos (J774), ensaio de tolerância ao stress ácido, ensaio de tolerância ao stress oxidativo. Ademais, será feito a análise do transcriptoma de duas linhagens de S. Typhimurium, os RNAs serão extraídos após os ensaios de tolerância ao stress ácido, ao stress oxidativo e em condições ideais de crescimento para tais linhagens. Além disto, será realizada a determinação da dose letal média (DL50) de duas linhagens selecionadas de S. Typhimurium. Ressalta-se que não existem trabalhos publicados que compararam linhagens de S. Typhimurium isoladas de períodos e de fontes distintas no país que reúnam análises do genoma completo, transcriptoma e testes fenotípicos acima mencionados. Em conjunto, os resultados a serem obtidos deverão contribuir para uma melhor caracterização da patogenicidade, virulência e diversidade genotípica desse importante enteropatógeno mundial. (AU)