Sequenciamento do genoma, transcriptoma e análise fenotípica de linhagens de Campylobacter coli isoladas de diversas fontes no Brasil

Resumo

A campilobacteriose é uma zoonose de distribuição mundial representando um enorme desafio para a saúde e um elevado impacto sócio econômico. As espécies C. coli e C. jejuni são causas comuns de gastroenterite em humanos afetando anualmente cerca de 2,4 milhões de pessoas nos Estados Unidos e estima-se que 9 milhões de pessoas na Europa. Entretanto, pouco se sabe a respeito do processo de patogênese desse gênero bacteriano, e dentre os poucos estudos realizados com esse propósito, até o momento, a grande maioria foi realizado para a espécie C. jejuni. Especificamente no Brasil, o estudo e o isolamento de C. coli não são muito frequentes, o que dificulta avaliar a importância desse patógeno no país. Esse projeto tem como objetivos analisar comparativamente por testes fenotípicos, sequenciamento do genoma e transcriptoma 50 linhagens de C. coli isoladas de humanos, animais, ambiente e alimentos, por 16 anos no país. Serão realizados para todas as linhagens testes fenotípicos de flutuação da temperatura, resistência ao NaCl, stress ácido e oxidativo, invasão à células epiteliais, multiplicação e sobrevivência em macrófagos de humanos (U937) e frangos (HD11) e análise da expressão de transcritos de citocinas inflamatórias em células CACO-2 por RT-qPCR para linhagens que apresentarem resultados significativos diante dos testes acima citados. Será realizado o sequenciamento do genoma total de 50 linhagens de C. coli e o sequenciamento do transcriptoma (RNA-seq) de duas linhagens de C. coli que apresentarem diferenças significativas frente aos testes fenotípicos acima citados. Os RNAs dessas linhagens serão extraídos após os ensaios de tolerância ao stress ácido e invasão a células CACO-2. Ademais, será realizada a determinação da dose letal média (DL50) dessas duas linhagens de C. coli. Devido à escassez de estudos envolvendo a espécie de C. coli, estudos que objetivem a elucidação da patogenicidade, virulência e diversidade genotípica são inéditos e de grande importância. Os resultados a serem obtidos deverão contribuir para uma melhor caracterização de C. coli isolados de diversas fontes durante 16 anos no Brasil, colaborando para um melhor entendimento da diversidade genotípica e fenotípica, patogenicidade e virulência desse patógeno considerado de grande importância mundial. (AU)