Análise fenotípica e sequenciamento do transcriptoma e genoma em linhagens de Salmonella Enteritidis isoladas no período pré e pós-pandemia no Brasil

Resumo

A doença decorrente da infecção por Salmonella é um dos maiores problemas de saúde no mundo em termos de morbidade e mortalidade. Entre as sorovariedades de Salmonella enterica, a Enteritidis (S. Enteritidis) compreende linhagens que possuem habilidade especializada de colonizar o trato reprodutivo de aves e contaminar componentes internos de ovos, o que possibilitou que S. Enteritidis se tornasse a mais comum das sorovariedades de Salmonella spp. causadoras de doenças em humanos. Apesar de não se saber ao certo os motivos que levaram a isso, acredita-se que um clone epidêmico e mais virulento tenha sido inserido no país pelo intercâmbio comercial de aves com outros países. Esse projeto tem como objetivo analisar comparativamente por testes fenotípicos, sequenciamento do transcriptoma e sequenciamento do genoma total, linhagens de Salmonella Enteritidis isoladas no período pré e pós-pandemia no Brasil. Para isso, serão estudadas 48 linhagens de S. Enteritidis, sendo 24 linhagens isoladas no período pré-pandemia (1968-1992) e 24 linhagens isoladas no período pós-pandemia (1993-2013) em vários locais do Brasil. As linhagens isoladas no período pré e pós-pandemia serão comparadas quanto à invasão a células epiteliais humanas e de frangos, capacidade de sobreviver à fagocitose por macrófagos de humanos e de frangos, sobrevivência ao stress ácido e oxidativo e crescimento na albumina do ovo. A comparação de genes expressos em cada um dos testes fenotípicos descritos acima será realizada para uma linhagem de Salmonella Enteritidis isoladas no período pré-pandemia e uma linhagem isolada no período pós-pandemia que apresentarem diferença significativa frente à maioria dos testes fenotípicos, utilizando-se o sequenciamento do transcriptoma. Os dados da expressão diferencial de genes serão validados por RT-PCR. Ademais, as duas linhagens selecionadas terão seu genoma sequenciado e sua dose letal mínima (DL50) determinada. Em conjunto, os resultados a serem obtidos deverão contribuir para uma melhor caracterização de S. Enteritidis, bem como fornecerão informações sobre as diferenças entre linhagens isoladas em período pré e pós-pandemia no país, o que poderá colaborar na elucidação dos motivos do início da pandemia no Brasil, bem como, poderá fornecer dados para outros estudos sobre a emergência da sorovariedade Enteritidis como a mais prevalente em vários locais do mundo.